26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0023 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0023  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0930619 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2355  hypothetical protein  69.23 
 
 
188 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0178  hypothetical protein  68.42 
 
 
200 aa  271  5.000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0520859  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2541  hypothetical protein  50 
 
 
191 aa  209  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1660  hypothetical protein  54.05 
 
 
201 aa  205  3e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000145701  hitchhiker  0.0000000000565897 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2221  hypothetical protein  46.91 
 
 
208 aa  174  6e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1361  hypothetical protein  47.51 
 
 
188 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0012643  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0137  hypothetical protein  46.41 
 
 
228 aa  171  5.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0458  conserved hypothetical protein-like protein  44.33 
 
 
213 aa  169  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1028  hypothetical protein  48.65 
 
 
203 aa  167  6e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0861228 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2027  hypothetical protein  46.7 
 
 
189 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.968984  normal  0.751952 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1444  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  41.09 
 
 
332 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1630  hypothetical protein  43.39 
 
 
204 aa  157  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.856032  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0624  hypothetical protein  43.87 
 
 
550 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802185  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3083  hypothetical protein  43.24 
 
 
615 aa  123  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2419  hypothetical protein  44.83 
 
 
520 aa  123  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.226401 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5195  conserved hypothetical protein-like protein  39.26 
 
 
617 aa  120  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1432  hypothetical protein  38.89 
 
 
289 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0804678 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0545  hypothetical protein  42.47 
 
 
556 aa  118  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0168127  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1373  hypothetical protein  36.36 
 
 
287 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1487  hypothetical protein  39.04 
 
 
282 aa  107  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.204521  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1249  hypothetical protein  37.41 
 
 
252 aa  98.2  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0513  hypothetical protein  33.1 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.651674  normal  0.711601 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1677  hypothetical protein  27.93 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2102  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.82 
 
 
237 aa  60.1  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0596  hypothetical protein  28.57 
 
 
257 aa  55.5  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0844954  normal  0.105487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>