26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0545 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0545  hypothetical protein  100 
 
 
556 aa  1060    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0168127  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0624  hypothetical protein  49.82 
 
 
550 aa  412  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802185  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2419  hypothetical protein  51.08 
 
 
520 aa  397  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.226401 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3083  hypothetical protein  62.96 
 
 
615 aa  314  1.9999999999999998e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5195  conserved hypothetical protein-like protein  62.4 
 
 
617 aa  311  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0458  conserved hypothetical protein-like protein  57.93 
 
 
213 aa  168  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2221  hypothetical protein  57.24 
 
 
208 aa  167  5.9999999999999996e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1028  hypothetical protein  56.85 
 
 
203 aa  166  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0861228 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1630  hypothetical protein  58.22 
 
 
204 aa  163  6e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.856032  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2027  hypothetical protein  45.59 
 
 
189 aa  163  9e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.968984  normal  0.751952 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0137  hypothetical protein  53.18 
 
 
228 aa  163  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1373  hypothetical protein  37.85 
 
 
287 aa  159  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1432  hypothetical protein  44.5 
 
 
289 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0804678 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1487  hypothetical protein  39.89 
 
 
282 aa  142  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.204521  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1361  hypothetical protein  49.66 
 
 
188 aa  140  6e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0012643  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1444  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  48.32 
 
 
332 aa  138  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2355  hypothetical protein  39.33 
 
 
188 aa  126  9e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0178  hypothetical protein  43.03 
 
 
200 aa  126  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0520859  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0023  hypothetical protein  42.47 
 
 
197 aa  118  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0930619 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2541  hypothetical protein  43.23 
 
 
191 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1249  hypothetical protein  35.71 
 
 
252 aa  95.1  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1660  hypothetical protein  36.49 
 
 
201 aa  93.6  8e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000145701  hitchhiker  0.0000000000565897 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1677  hypothetical protein  33.11 
 
 
257 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2102  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  36.3 
 
 
237 aa  69.3  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0596  hypothetical protein  24.14 
 
 
257 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0844954  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0513  hypothetical protein  30.7 
 
 
232 aa  45.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.651674  normal  0.711601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>