26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0513 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0513  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  467  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.651674  normal  0.711601 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1249  hypothetical protein  29.2 
 
 
252 aa  99  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2102  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.49 
 
 
237 aa  95.1  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1677  hypothetical protein  26.48 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2541  hypothetical protein  31.93 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2355  hypothetical protein  36.08 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0023  hypothetical protein  33.1 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0930619 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1373  hypothetical protein  24.73 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1630  hypothetical protein  29.15 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.856032  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1660  hypothetical protein  31.65 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000145701  hitchhiker  0.0000000000565897 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0178  hypothetical protein  35.86 
 
 
200 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0520859  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0596  hypothetical protein  29.15 
 
 
257 aa  62.4  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0844954  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3083  hypothetical protein  32.17 
 
 
615 aa  61.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5195  conserved hypothetical protein-like protein  30.07 
 
 
617 aa  61.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0137  hypothetical protein  36.04 
 
 
228 aa  59.3  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2027  hypothetical protein  31.91 
 
 
189 aa  58.9  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.968984  normal  0.751952 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1028  hypothetical protein  29.53 
 
 
203 aa  57  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0861228 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2419  hypothetical protein  30.77 
 
 
520 aa  56.6  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.226401 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1432  hypothetical protein  27.43 
 
 
289 aa  56.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0804678 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2221  hypothetical protein  25.35 
 
 
208 aa  55.8  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1487  hypothetical protein  28.57 
 
 
282 aa  54.3  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.204521  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0624  hypothetical protein  30.77 
 
 
550 aa  53.9  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802185  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0458  conserved hypothetical protein-like protein  26.9 
 
 
213 aa  53.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1361  hypothetical protein  30.09 
 
 
188 aa  51.6  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0012643  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1444  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  28.32 
 
 
332 aa  46.6  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0545  hypothetical protein  30.7 
 
 
556 aa  45.1  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0168127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>