26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0624 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0624  hypothetical protein  100 
 
 
550 aa  1040    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802185  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0545  hypothetical protein  49.74 
 
 
556 aa  421  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0168127  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2419  hypothetical protein  50.27 
 
 
520 aa  375  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.226401 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3083  hypothetical protein  60.96 
 
 
615 aa  288  2e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5195  conserved hypothetical protein-like protein  60.44 
 
 
617 aa  282  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2221  hypothetical protein  59.46 
 
 
208 aa  177  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0458  conserved hypothetical protein-like protein  58.11 
 
 
213 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1373  hypothetical protein  40.36 
 
 
287 aa  172  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1028  hypothetical protein  48.83 
 
 
203 aa  170  7e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0861228 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0137  hypothetical protein  55.77 
 
 
228 aa  167  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1432  hypothetical protein  46.28 
 
 
289 aa  163  9e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0804678 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1630  hypothetical protein  52.63 
 
 
204 aa  160  8e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.856032  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2027  hypothetical protein  43.75 
 
 
189 aa  159  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.968984  normal  0.751952 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1361  hypothetical protein  41.95 
 
 
188 aa  152  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0012643  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1444  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  38.7 
 
 
332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2355  hypothetical protein  47.5 
 
 
188 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1487  hypothetical protein  37.38 
 
 
282 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.204521  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0178  hypothetical protein  44.83 
 
 
200 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0520859  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0023  hypothetical protein  43.87 
 
 
197 aa  125  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0930619 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2541  hypothetical protein  41.03 
 
 
191 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1660  hypothetical protein  41.22 
 
 
201 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000145701  hitchhiker  0.0000000000565897 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1249  hypothetical protein  41.43 
 
 
252 aa  91.7  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2102  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  40.41 
 
 
237 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1677  hypothetical protein  35.71 
 
 
257 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0513  hypothetical protein  30.77 
 
 
232 aa  53.9  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.651674  normal  0.711601 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0596  hypothetical protein  26.01 
 
 
257 aa  47.8  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0844954  normal  0.105487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>