22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2000 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2000  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  848    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0983  hypothetical protein  70.49 
 
 		 416 aa  594  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0157  hypothetical protein  36.43 
 
 		 382 aa  248  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1417  hypothetical protein  35.82 
 
 		 367 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2875  hypothetical protein  32.57 
 
 		 397 aa  179  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1778  hypothetical protein  36.63 
 
 		 216 aa  146  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000267624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1237  hypothetical protein  27.92 
 
 		 474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2236  hypothetical protein  28.88 
 
 		 424 aa  119  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1779  hypothetical protein  45.45 
 
 		 148 aa  113  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000647609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0072  phosphate-selective porin O and P  26.68 
 
 		 396 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1204  phosphate-selective porin O and P  25.33 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755858  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1175  outer membrane porin FmdC, putative  25.39 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000392921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2939  outer membrane porin FmdC, putative  24.35 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.440983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0532  phosphate-selective porin O and P  26.23 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000620522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4122  phosphate-selective porin O and P  26.54 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.556284 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4031  phosphate-selective porin O and P  26.52 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364483  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0445  phosphate-selective porin O and P  24.72 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0451  phosphate-selective porin O and P  24.93 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298497  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0462  hypothetical protein  25.12 
 
 		 530 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.369233  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1253  hypothetical protein  30.1 
 
 		 455 aa  46.6  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00910104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4458  hypothetical protein  26.86 
 
 		 458 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0073  phosphate-selective porin O and P  24.51 
 
 		 390 aa  45.1  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>