32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0445 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4122  phosphate-selective porin O and P  75.31 
 
 		 399 aa  641    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.556284 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4031  phosphate-selective porin O and P  75.87 
 
 		 400 aa  638    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364483  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0445  phosphate-selective porin O and P  100 
 
 		 401 aa  822    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0451  phosphate-selective porin O and P  94.51 
 
 		 401 aa  779    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298497  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2939  outer membrane porin FmdC, putative  71.18 
 
 		 406 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.440983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0532  phosphate-selective porin O and P  68.92 
 
 		 415 aa  593  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000620522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1204  phosphate-selective porin O and P  68.33 
 
 		 403 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755858  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0072  phosphate-selective porin O and P  38.88 
 
 		 396 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1175  outer membrane porin FmdC, putative  32.57 
 
 		 489 aa  192  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000392921  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1417  hypothetical protein  26.8 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0073  phosphate-selective porin O and P  27.59 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0939  hypothetical protein  21.82 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000462454  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2000  hypothetical protein  24.72 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0510  phosphate-selective porin O and P  24.73 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442371  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0056  hypothetical protein  24.29 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000444943  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0272  hypothetical protein  24.47 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1253  hypothetical protein  25.07 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00910104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0960  hypothetical protein  23.79 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000766698  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0983  hypothetical protein  24.06 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0462  hypothetical protein  22.77 
 
 		 530 aa  57  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.369233  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5810  hypothetical protein  26.7 
 
 		 442 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00960319 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1473  hypothetical protein  25.81 
 
 		 494 aa  52.4  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00085768  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1055  hypothetical protein  24.29 
 
 		 465 aa  52.4  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114803  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4495  phosphate-selective porin O and P  34.15 
 
 		 554 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4013  phosphate-selective porin O and P  33.33 
 
 		 502 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4382  phosphate-selective porin O and P  33.33 
 
 		 502 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0801  phosphate-selective porin O and P  32.37 
 
 		 473 aa  49.7  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.167579  normal  0.676096 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0352  hypothetical protein  22.97 
 
 		 448 aa  47.8  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000257502  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2627  phosphate-selective porin O and P  24.75 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00186911  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0157  hypothetical protein  23.1 
 
 		 382 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1237  hypothetical protein  23.6 
 
 		 474 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4128  phosphate-selective porin O and P  23.37 
 
 		 426 aa  43.5  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.611373 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>