36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2939 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2939  outer membrane porin FmdC, putative  100 
 
 		 406 aa  835    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.440983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0532  phosphate-selective porin O and P  77.35 
 
 		 415 aa  674    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000620522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0445  phosphate-selective porin O and P  71.18 
 
 		 401 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0451  phosphate-selective porin O and P  71.43 
 
 		 401 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298497  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4122  phosphate-selective porin O and P  67.49 
 
 		 399 aa  567  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.556284 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1204  phosphate-selective porin O and P  65.93 
 
 		 403 aa  565  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755858  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4031  phosphate-selective porin O and P  66.01 
 
 		 400 aa  560  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364483  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0072  phosphate-selective porin O and P  39.14 
 
 		 396 aa  247  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1175  outer membrane porin FmdC, putative  34.03 
 
 		 489 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000392921  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0510  phosphate-selective porin O and P  26.64 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442371  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2000  hypothetical protein  24.35 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1417  hypothetical protein  22.51 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0983  hypothetical protein  24.02 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0272  hypothetical protein  24.88 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1253  hypothetical protein  24.14 
 
 		 455 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00910104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0073  phosphate-selective porin O and P  21.69 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0157  hypothetical protein  23.22 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5810  hypothetical protein  28.57 
 
 		 442 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00960319 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0462  hypothetical protein  22.55 
 
 		 530 aa  52.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.369233  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02677  Phosphate-selective porin O and P  23.43 
 
 		 406 aa  49.7  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631754  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4013  phosphate-selective porin O and P  35.51 
 
 		 502 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4382  phosphate-selective porin O and P  35.51 
 
 		 502 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2627  phosphate-selective porin O and P  23 
 
 		 417 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00186911  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0947  hypothetical protein  31.01 
 
 		 512 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0960  hypothetical protein  22.51 
 
 		 445 aa  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000766698  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0801  phosphate-selective porin O and P  31.82 
 
 		 473 aa  47  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.167579  normal  0.676096 
 
 
-
 
NC_002950  PG1382  hypothetical protein  25.71 
 
 		 379 aa  46.6  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0246633 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2588  phosphate-selective porin O and P  28.69 
 
 		 480 aa  46.2  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1055  hypothetical protein  23.89 
 
 		 465 aa  46.2  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114803  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4128  phosphate-selective porin O and P  25.19 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.611373 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2169  phosphate-selective porin O and P  31.48 
 
 		 475 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0882405  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4495  phosphate-selective porin O and P  32.14 
 
 		 554 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03751  phosphate-selective porin O and P  30.5 
 
 		 292 aa  44.3  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0056  hypothetical protein  21.26 
 
 		 459 aa  43.9  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000444943  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4458  hypothetical protein  21.36 
 
 		 458 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1473  hypothetical protein  21.23 
 
 		 494 aa  43.1  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00085768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>