24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1417 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1417  hypothetical protein  100 
 
 		 367 aa  743    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0157  hypothetical protein  37.43 
 
 		 382 aa  236  6e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0983  hypothetical protein  36.27 
 
 		 416 aa  226  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2000  hypothetical protein  35.82 
 
 		 418 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2875  hypothetical protein  36.66 
 
 		 397 aa  195  8.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1237  hypothetical protein  34.94 
 
 		 474 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2236  hypothetical protein  35.86 
 
 		 424 aa  170  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1778  hypothetical protein  42.27 
 
 		 216 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000267624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0072  phosphate-selective porin O and P  24.23 
 
 		 396 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0532  phosphate-selective porin O and P  24.61 
 
 		 415 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000620522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4122  phosphate-selective porin O and P  25.54 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.556284 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1779  hypothetical protein  37.76 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000647609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4031  phosphate-selective porin O and P  25.46 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364483  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0445  phosphate-selective porin O and P  26.8 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0451  phosphate-selective porin O and P  32.61 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298497  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1204  phosphate-selective porin O and P  28.8 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755858  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2939  outer membrane porin FmdC, putative  22.51 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.440983  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1175  outer membrane porin FmdC, putative  26.03 
 
 		 489 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000392921  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0073  phosphate-selective porin O and P  26.98 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0939  hypothetical protein  25.87 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000462454  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1253  hypothetical protein  26.95 
 
 		 455 aa  50.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00910104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0056  hypothetical protein  23.32 
 
 		 459 aa  50.1  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000444943  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0352  hypothetical protein  24.42 
 
 		 448 aa  48.5  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000257502  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1055  hypothetical protein  24.13 
 
 		 465 aa  46.2  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>