36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6164 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6164  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  388  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.919124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5550  putative PAS/PAC sensor protein  56.38 
 
 		 141 aa  99  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2133  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 		 141 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0362  putative PAS/PAC sensor protein  40.34 
 
 		 141 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6742  putative PAS/PAC sensor protein  42.42 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.63921  normal  0.585827 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1034  putative PAS/PAC sensor protein  37.61 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0282  transcriptional regulator  36.97 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.283126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2658  putative PAS/PAC sensor protein  35.65 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1781  putative PAS/PAC sensor protein  34.78 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.345246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2168  putative PAS/PAC sensor protein  34.78 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.242596  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1710  putative PAS/PAC sensor protein  34.78 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.010044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4662  PAS  39.13 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1202  putative PAS/PAC sensor protein  37.39 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2761  putative PAS/PAC sensor protein  40.86 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3701  putative PAS/PAC sensor protein  33.04 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0214  putative PAS/PAC sensor protein  36.52 
 
 		 144 aa  64.3  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4051  putative PAS/PAC sensor protein  42.86 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.949542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4841  putative PAS/PAC sensor protein  40.22 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3616  putative PAS/PAC sensor protein  39.78 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1366  putative PAS/PAC sensor protein  38.3 
 
 		 149 aa  62  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1206  PAS sensor protein  37.23 
 
 		 149 aa  62  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1145  putative PAS/PAC sensor protein  38.3 
 
 		 149 aa  62  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2802  putative PAS/PAC sensor protein  35.16 
 
 		 152 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.540476  normal  0.477024 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0639  putative PAS/PAC sensor protein  34.62 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0483  putative PAS/PAC sensor protein  31.62 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000401014 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0298  putative PAS/PAC sensor protein  33.06 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.169835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0466  putative PAS/PAC sensor protein  30.58 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.98341  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3857  putative PAS/PAC sensor protein  31.3 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.759378  normal  0.914632 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5581  putative PAS/PAC sensor protein  38.1 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.595222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4485  putative PAS/PAC sensor protein  32.73 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3172  putative PAS/PAC sensor protein  32.17 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.920236  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3152  sensory box protein  33.61 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0993  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 		 146 aa  51.6  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0488  putative PAS/PAC sensor protein  30.43 
 
 		 148 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1568  transcriptional regulator  30.61 
 
 		 139 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683844  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2500  putative PAS/PAC sensor protein  32.38 
 
 		 143 aa  49.3  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>