31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2505 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2505  hypothetical protein  100 
 
 		 518 aa  1030    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0067  integrase family protein  31.97 
 
 		 526 aa  206  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.620539 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2339  hypothetical protein  28.26 
 
 		 483 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.562692  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2182  hypothetical protein  28.26 
 
 		 483 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3786  hypothetical protein  28.23 
 
 		 485 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5192  hypothetical protein  24.85 
 
 		 520 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0504  hypothetical protein  23.69 
 
 		 535 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  22.59 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  23.17 
 
 		 419 aa  57  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1977  hypothetical protein  24.04 
 
 		 507 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  24.65 
 
 		 414 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  29.12 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2324  hypothetical protein  29.93 
 
 		 161 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2169  hypothetical protein  29.93 
 
 		 161 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.188438 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4142  integrase family protein  28.47 
 
 		 401 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  22.77 
 
 		 390 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4145  hypothetical protein  28.09 
 
 		 205 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  24.14 
 
 		 413 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  26.71 
 
 		 422 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  26.09 
 
 		 422 aa  47.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  21.69 
 
 		 406 aa  47.8  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  24.17 
 
 		 515 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  23.78 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  22.15 
 
 		 428 aa  45.8  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  26.71 
 
 		 439 aa  45.8  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0229  phage integrase  26.28 
 
 		 401 aa  46.2  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1070  integrase family protein  27.46 
 
 		 365 aa  44.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1063  integrase family protein  27.46 
 
 		 359 aa  44.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0966  phage integrase  22.29 
 
 		 410 aa  44.3  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0357996 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  22.86 
 
 		 404 aa  43.9  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  25 
 
 		 432 aa  43.5  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>