11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2169 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2169  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  332  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.188438 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2324  hypothetical protein  99.38 
 
 		 161 aa  330  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3786  hypothetical protein  83.44 
 
 		 485 aa  274  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2182  hypothetical protein  83.44 
 
 		 483 aa  272  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2339  hypothetical protein  83.44 
 
 		 483 aa  272  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.562692  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0067  integrase family protein  32.43 
 
 		 526 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.620539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2505  hypothetical protein  29.93 
 
 		 518 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  29.17 
 
 		 395 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  24.18 
 
 		 414 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0657  phage integrase family protein  25 
 
 		 412 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907789  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1604  phage integrase family protein  28 
 
 		 459 aa  40.8  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>