16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0067 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0067  integrase family protein  100 
 
 		 526 aa  1061    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.620539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2505  hypothetical protein  32.08 
 
 		 518 aa  200  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2339  hypothetical protein  31.79 
 
 		 483 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.562692  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2182  hypothetical protein  31.79 
 
 		 483 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3786  hypothetical protein  31.84 
 
 		 485 aa  170  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5192  hypothetical protein  26.29 
 
 		 520 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1977  hypothetical protein  23.75 
 
 		 507 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2169  hypothetical protein  32.43 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.188438 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2324  hypothetical protein  32.43 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  26.33 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0504  hypothetical protein  23.64 
 
 		 535 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  26.04 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  22.52 
 
 		 396 aa  48.5  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  20.04 
 
 		 422 aa  47  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  24.14 
 
 		 413 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  29.57 
 
 		 410 aa  43.9  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>