32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2339 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2182  hypothetical protein  99.79 
 
 		 483 aa  975    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3786  hypothetical protein  88.45 
 
 		 485 aa  855    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2339  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  976    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.562692  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2324  hypothetical protein  83.44 
 
 		 161 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2169  hypothetical protein  83.44 
 
 		 161 aa  272  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.188438 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0067  integrase family protein  31.77 
 
 		 526 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.620539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2505  hypothetical protein  28.73 
 
 		 518 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  24.03 
 
 		 400 aa  66.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  22.07 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  24.2 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  25.16 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  23.59 
 
 		 410 aa  53.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  23.08 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  23.54 
 
 		 390 aa  51.6  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  23.15 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  22.25 
 
 		 410 aa  50.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  22.54 
 
 		 426 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  24.75 
 
 		 440 aa  48.5  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  24.28 
 
 		 395 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  23.86 
 
 		 398 aa  47.4  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1977  hypothetical protein  23.32 
 
 		 507 aa  47  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  23.56 
 
 		 413 aa  46.6  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  23.66 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2956  integrase family protein  22.38 
 
 		 487 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1604  phage integrase family protein  24.44 
 
 		 459 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  20.6 
 
 		 406 aa  45.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  23.68 
 
 		 395 aa  44.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3095  integrase family protein  27.7 
 
 		 392 aa  44.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000033184 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  24 
 
 		 400 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  24.67 
 
 		 401 aa  43.9  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1348  phage integrase family protein  23.21 
 
 		 391 aa  43.5  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  23.17 
 
 		 402 aa  43.5  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>