13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1977 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1977  hypothetical protein  100 
 
 		 507 aa  1009    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5192  hypothetical protein  44.33 
 
 		 520 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0504  hypothetical protein  40.74 
 
 		 535 aa  346  5e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0067  integrase family protein  23.75 
 
 		 526 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.620539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2505  hypothetical protein  24.04 
 
 		 518 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2339  hypothetical protein  24.11 
 
 		 483 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.562692  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2182  hypothetical protein  23.94 
 
 		 483 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2501  phage integrase, putative  26.25 
 
 		 469 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  25.49 
 
 		 414 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0151  phage integrase  28.57 
 
 		 429 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4522  phage integrase  28.08 
 
 		 429 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3786  hypothetical protein  23.37 
 
 		 485 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2013  integrase  33.65 
 
 		 409 aa  43.5  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0417759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>