36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0288 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0288  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213851  normal  0.0255605 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4804  hypothetical protein  72.77 
 
 		 207 aa  290  8e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3050  hypothetical protein  47.24 
 
 		 170 aa  158  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2289  hypothetical protein  30.49 
 
 		 157 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2448  hypothetical protein  30.49 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2844  conserved hypothetical protein  29.59 
 
 		 149 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00765  hypothetical protein  29.59 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00782  hypothetical protein  29.59 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2845  hypothetical protein  29.59 
 
 		 149 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.063186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0854  hypothetical protein  29.59 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000986  uncharacterized domain/GTP cyclohydrolase II  28.92 
 
 		 353 aa  62  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0270  hypothetical protein  29.76 
 
 		 157 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677549 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0433  hypothetical protein  30.49 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07041  hypothetical protein  28.31 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1696  hypothetical protein  28.05 
 
 		 142 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0575621  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3165  hypothetical protein  29.27 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0865  hypothetical protein  29.1 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2554  hypothetical protein  29.85 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0354  hypothetical protein  29.88 
 
 		 148 aa  51.6  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000171392  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3371  hypothetical protein  26.55 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000316339  unclonable  1.45401e-17 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2797  hypothetical protein  29.88 
 
 		 150 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.744208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1431  hypothetical protein  31.29 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.130187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1731  hypothetical protein  28.22 
 
 		 142 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.365921  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1897  hypothetical protein  28.05 
 
 		 157 aa  49.3  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0074  hypothetical protein  28.22 
 
 		 182 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1181  hypothetical protein  24.84 
 
 		 164 aa  48.9  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.406635  hitchhiker  0.00458574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0405  hypothetical protein  32.35 
 
 		 168 aa  48.1  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3211  hypothetical protein  26.92 
 
 		 336 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0385852 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5761  hypothetical protein  28.4 
 
 		 193 aa  44.7  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000051993 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4523  hypothetical protein  29.75 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.584646 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35648  predicted protein  26.32 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000129267  normal  0.75627 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0151  hypothetical protein  35.71 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3505  hypothetical protein  29.07 
 
 		 173 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.42017  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2006  hypothetical protein  31.65 
 
 		 287 aa  42.7  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.436059  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6789  hypothetical protein  33.04 
 
 		 161 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5219  hypothetical protein  27.88 
 
 		 180 aa  41.6  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>