52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3211 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3211  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  687    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0385852 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3371  hypothetical protein  62.12 
 
 
219 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000316339  unclonable  1.45401e-17 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1771  hypothetical protein  61.38 
 
 
217 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2844  conserved hypothetical protein  35.1 
 
 
149 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00765  hypothetical protein  35.1 
 
 
160 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00782  hypothetical protein  35.1 
 
 
160 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2845  hypothetical protein  35.1 
 
 
149 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.063186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0854  hypothetical protein  35.1 
 
 
160 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07041  hypothetical protein  35.57 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2448  hypothetical protein  33.55 
 
 
146 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3165  hypothetical protein  32.68 
 
 
155 aa  73.9  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0354  hypothetical protein  34.23 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000171392  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2289  hypothetical protein  31.79 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1431  hypothetical protein  35.42 
 
 
144 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.130187  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3050  hypothetical protein  33.73 
 
 
170 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0865  hypothetical protein  36.49 
 
 
160 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2554  hypothetical protein  35.71 
 
 
160 aa  67.4  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35648  predicted protein  31.25 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000129267  normal  0.75627 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000986  uncharacterized domain/GTP cyclohydrolase II  32.21 
 
 
353 aa  66.2  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0433  hypothetical protein  35.44 
 
 
161 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1897  hypothetical protein  31.58 
 
 
157 aa  63.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0270  hypothetical protein  31.9 
 
 
157 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677549 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1319  hypothetical protein  42.67 
 
 
453 aa  62.8  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.249275  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2797  hypothetical protein  31.29 
 
 
150 aa  62.4  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.744208  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1696  hypothetical protein  28.77 
 
 
142 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0575621  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1181  hypothetical protein  30.88 
 
 
164 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.406635  hitchhiker  0.00458574 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2146  hypothetical protein  32.9 
 
 
150 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.657037 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2102  hypothetical protein  32.9 
 
 
150 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1731  hypothetical protein  27.4 
 
 
142 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.365921  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0288  hypothetical protein  28.65 
 
 
199 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213851  normal  0.0255605 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60590  hypothetical protein  30.5 
 
 
184 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2199  hypothetical protein  29.17 
 
 
184 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2006  hypothetical protein  31.88 
 
 
287 aa  50.4  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.436059  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0151  hypothetical protein  28.87 
 
 
197 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4804  hypothetical protein  26.9 
 
 
207 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0008  hypothetical protein  29.63 
 
 
183 aa  49.3  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6789  hypothetical protein  31.19 
 
 
161 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4523  hypothetical protein  28.99 
 
 
189 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.584646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1821  hypothetical protein  28.26 
 
 
182 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.758753  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2467  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  31.34 
 
 
439 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2846  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  29.25 
 
 
454 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0526623  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5219  hypothetical protein  30.28 
 
 
180 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0152  hypothetical protein  29.63 
 
 
183 aa  46.2  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0750  hypothetical protein  31.34 
 
 
175 aa  46.2  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0674  hypothetical protein  40 
 
 
413 aa  46.2  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.111926  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5761  hypothetical protein  28.95 
 
 
193 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000051993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0074  hypothetical protein  33.04 
 
 
182 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2927  hypothetical protein  28.07 
 
 
201 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0506294  normal  0.0176003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2401  hypothetical protein  30.56 
 
 
192 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.135537 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3361  hypothetical protein  26.71 
 
 
187 aa  43.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.09095  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0560  hypothetical protein  24.03 
 
 
460 aa  42.7  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0528285  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5003  hypothetical protein  28.46 
 
 
172 aa  42.7  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.468369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>