33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3371 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3371  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000316339  unclonable  1.45401e-17 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3211  hypothetical protein  62.12 
 
 
336 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0385852 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1771  hypothetical protein  58.95 
 
 
217 aa  222  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2844  conserved hypothetical protein  37.84 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2845  hypothetical protein  37.84 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.063186 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00782  hypothetical protein  38.51 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00765  hypothetical protein  38.51 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0854  hypothetical protein  38.51 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0865  hypothetical protein  39.07 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07041  hypothetical protein  35.12 
 
 
164 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2554  hypothetical protein  38.41 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2797  hypothetical protein  34.23 
 
 
150 aa  72  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.744208  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35648  predicted protein  35.4 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000129267  normal  0.75627 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000986  uncharacterized domain/GTP cyclohydrolase II  32.14 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1431  hypothetical protein  36.73 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.130187  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0354  hypothetical protein  34.23 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000171392  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2448  hypothetical protein  31.51 
 
 
146 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1696  hypothetical protein  29.05 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0575621  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0270  hypothetical protein  34.21 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677549 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1897  hypothetical protein  31.41 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1181  hypothetical protein  32.37 
 
 
164 aa  63.2  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.406635  hitchhiker  0.00458574 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2146  hypothetical protein  31.58 
 
 
150 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.657037 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2102  hypothetical protein  31.58 
 
 
150 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2289  hypothetical protein  30 
 
 
157 aa  62.4  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1731  hypothetical protein  29.73 
 
 
142 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.365921  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3165  hypothetical protein  28.29 
 
 
155 aa  57.8  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0433  hypothetical protein  31.01 
 
 
161 aa  54.3  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3050  hypothetical protein  29.94 
 
 
170 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0288  hypothetical protein  26.55 
 
 
199 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213851  normal  0.0255605 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0405  hypothetical protein  33 
 
 
168 aa  48.9  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4523  hypothetical protein  30.15 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.584646 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2006  hypothetical protein  31.53 
 
 
287 aa  46.2  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.436059  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4804  hypothetical protein  26.55 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>