49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3050 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3050  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  350  7e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4804  hypothetical protein  49.09 
 
 
207 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0288  hypothetical protein  47.24 
 
 
199 aa  158  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213851  normal  0.0255605 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00765  hypothetical protein  41.78 
 
 
160 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00782  hypothetical protein  41.78 
 
 
160 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0854  hypothetical protein  41.78 
 
 
160 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2844  conserved hypothetical protein  41.78 
 
 
149 aa  91.7  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2845  hypothetical protein  41.78 
 
 
149 aa  91.7  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.063186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1431  hypothetical protein  38.82 
 
 
144 aa  84  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.130187  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0354  hypothetical protein  39.73 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000171392  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3165  hypothetical protein  35.22 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2448  hypothetical protein  38.36 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0270  hypothetical protein  36.08 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677549 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0865  hypothetical protein  38.36 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2554  hypothetical protein  38.36 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1696  hypothetical protein  35.42 
 
 
142 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0575621  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1897  hypothetical protein  38.19 
 
 
157 aa  73.9  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1731  hypothetical protein  34.97 
 
 
142 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.365921  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2289  hypothetical protein  34.9 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35648  predicted protein  32.72 
 
 
169 aa  71.2  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000129267  normal  0.75627 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000986  uncharacterized domain/GTP cyclohydrolase II  35.76 
 
 
353 aa  70.9  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07041  hypothetical protein  35.44 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0433  hypothetical protein  34.78 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1181  hypothetical protein  34.31 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.406635  hitchhiker  0.00458574 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2797  hypothetical protein  35.57 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.744208  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3211  hypothetical protein  31.91 
 
 
336 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0385852 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3361  hypothetical protein  33.81 
 
 
187 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.09095  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2146  hypothetical protein  33.77 
 
 
150 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.657037 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2102  hypothetical protein  33.77 
 
 
150 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3371  hypothetical protein  29.94 
 
 
219 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000316339  unclonable  1.45401e-17 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0074  hypothetical protein  33.08 
 
 
182 aa  51.2  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0151  hypothetical protein  30.19 
 
 
197 aa  50.8  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0152  hypothetical protein  30.52 
 
 
183 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0120146  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1771  hypothetical protein  32.45 
 
 
217 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2927  hypothetical protein  30.2 
 
 
201 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0506294  normal  0.0176003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1821  hypothetical protein  33.11 
 
 
182 aa  49.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.758753  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3505  hypothetical protein  28.66 
 
 
173 aa  48.5  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.42017  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2199  hypothetical protein  30 
 
 
184 aa  48.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2006  hypothetical protein  31.78 
 
 
287 aa  48.1  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.436059  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0750  hypothetical protein  28.86 
 
 
175 aa  47.8  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248432  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5761  hypothetical protein  30.34 
 
 
193 aa  47.8  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000051993 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0405  hypothetical protein  29.05 
 
 
168 aa  47.8  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0008  hypothetical protein  30.15 
 
 
183 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4523  hypothetical protein  29.8 
 
 
189 aa  45.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.584646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5219  hypothetical protein  31.13 
 
 
180 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60590  hypothetical protein  29.73 
 
 
184 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2022  hypothetical protein  31.3 
 
 
286 aa  42.4  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0365  hypothetical protein  31.33 
 
 
263 aa  41.2  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2401  hypothetical protein  26.58 
 
 
192 aa  40.8  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.135537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>