54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1897 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_1897  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  329  9e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2797  hypothetical protein  73.33 
 
 
150 aa  230  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.744208  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1696  hypothetical protein  56.74 
 
 
142 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0575621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1731  hypothetical protein  56.74 
 
 
142 aa  176  8e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.365921  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2448  hypothetical protein  50.34 
 
 
146 aa  158  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0354  hypothetical protein  51.02 
 
 
148 aa  154  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000171392  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2146  hypothetical protein  50 
 
 
150 aa  147  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.657037 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2102  hypothetical protein  50 
 
 
150 aa  147  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0270  hypothetical protein  52.78 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677549 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3165  hypothetical protein  48.63 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2845  hypothetical protein  48.23 
 
 
149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.063186 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00782  hypothetical protein  48.23 
 
 
160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00765  hypothetical protein  48.23 
 
 
160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0854  hypothetical protein  48.23 
 
 
160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2844  conserved hypothetical protein  48.23 
 
 
149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2289  hypothetical protein  49.31 
 
 
157 aa  136  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1431  hypothetical protein  48.94 
 
 
144 aa  131  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.130187  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2554  hypothetical protein  48.23 
 
 
160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0865  hypothetical protein  48.23 
 
 
160 aa  124  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0433  hypothetical protein  38.75 
 
 
161 aa  113  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000986  uncharacterized domain/GTP cyclohydrolase II  42.25 
 
 
353 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1181  hypothetical protein  41.22 
 
 
164 aa  104  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.406635  hitchhiker  0.00458574 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35648  predicted protein  35.48 
 
 
169 aa  102  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000129267  normal  0.75627 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07041  hypothetical protein  39.58 
 
 
164 aa  98.6  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0405  hypothetical protein  37.61 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3050  hypothetical protein  38.19 
 
 
170 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2199  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5761  hypothetical protein  36.3 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000051993 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4523  hypothetical protein  34.27 
 
 
189 aa  67.4  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.584646 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60590  hypothetical protein  34.72 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6789  hypothetical protein  30.99 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3371  hypothetical protein  31.41 
 
 
219 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000316339  unclonable  1.45401e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5219  hypothetical protein  33.33 
 
 
180 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4804  hypothetical protein  29.45 
 
 
207 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0750  hypothetical protein  32.64 
 
 
175 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0074  hypothetical protein  31.51 
 
 
182 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2006  hypothetical protein  32.37 
 
 
287 aa  57  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.436059  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1821  hypothetical protein  29.5 
 
 
182 aa  55.1  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.758753  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3505  hypothetical protein  33.86 
 
 
173 aa  54.7  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.42017  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3211  hypothetical protein  30.71 
 
 
336 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0385852 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3136  hypothetical protein  26.99 
 
 
165 aa  54.3  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3361  hypothetical protein  31.85 
 
 
187 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.09095  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2401  hypothetical protein  33.6 
 
 
192 aa  53.9  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.135537 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0152  hypothetical protein  30.99 
 
 
183 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2022  hypothetical protein  31.43 
 
 
286 aa  53.5  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0151  hypothetical protein  29.33 
 
 
197 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5873  hypothetical protein  31.68 
 
 
168 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2927  hypothetical protein  30.94 
 
 
201 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0506294  normal  0.0176003 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5003  hypothetical protein  28.29 
 
 
172 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.468369 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0008  hypothetical protein  32 
 
 
183 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0288  hypothetical protein  26.38 
 
 
199 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213851  normal  0.0255605 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1771  hypothetical protein  28.38 
 
 
217 aa  48.5  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0365  hypothetical protein  30.83 
 
 
263 aa  47.4  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2783  hypothetical protein  35.82 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347405  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>