54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2844 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2844  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  311  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00782  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  312  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2845  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  311  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.063186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0854  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  312  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00765  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  312  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2554  hypothetical protein  98.66 
 
 		 160 aa  308  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0865  hypothetical protein  97.99 
 
 		 160 aa  281  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0354  hypothetical protein  57.14 
 
 		 148 aa  169  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000171392  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1431  hypothetical protein  56.34 
 
 		 144 aa  167  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.130187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2448  hypothetical protein  51.41 
 
 		 146 aa  150  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1696  hypothetical protein  44.29 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0575621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1731  hypothetical protein  44.29 
 
 		 142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.365921  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1897  hypothetical protein  48.23 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1181  hypothetical protein  48.85 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.406635  hitchhiker  0.00458574 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2797  hypothetical protein  45.52 
 
 		 150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.744208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000986  uncharacterized domain/GTP cyclohydrolase II  44.14 
 
 		 353 aa  130  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0433  hypothetical protein  44.59 
 
 		 161 aa  127  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07041  hypothetical protein  45.52 
 
 		 164 aa  127  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0270  hypothetical protein  41.67 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2102  hypothetical protein  46.58 
 
 		 150 aa  123  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2146  hypothetical protein  46.58 
 
 		 150 aa  123  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.657037 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3165  hypothetical protein  42.66 
 
 		 155 aa  122  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2289  hypothetical protein  43.36 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35648  predicted protein  38.71 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000129267  normal  0.75627 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3050  hypothetical protein  41.78 
 
 		 170 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3371  hypothetical protein  37.84 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000316339  unclonable  1.45401e-17 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1771  hypothetical protein  37.16 
 
 		 217 aa  80.9  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4804  hypothetical protein  34.32 
 
 		 207 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0405  hypothetical protein  32.23 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3361  hypothetical protein  33.78 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.09095  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2199  hypothetical protein  34.56 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0750  hypothetical protein  31.69 
 
 		 175 aa  67  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60590  hypothetical protein  32.68 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2006  hypothetical protein  29.68 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.436059  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3211  hypothetical protein  31.91 
 
 		 336 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0385852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5219  hypothetical protein  32.68 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0288  hypothetical protein  29.41 
 
 		 199 aa  63.9  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213851  normal  0.0255605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0074  hypothetical protein  32.61 
 
 		 182 aa  63.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5761  hypothetical protein  32.09 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000051993 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4523  hypothetical protein  32.39 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.584646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2927  hypothetical protein  31.88 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0506294  normal  0.0176003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1821  hypothetical protein  29.86 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.758753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3505  hypothetical protein  31.62 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.42017  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0008  hypothetical protein  30.83 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0151  hypothetical protein  28.87 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6789  hypothetical protein  33.05 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0152  hypothetical protein  29.5 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3136  hypothetical protein  30.32 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2401  hypothetical protein  31.34 
 
 		 192 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.135537 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2022  hypothetical protein  32.54 
 
 		 286 aa  52.8  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5873  hypothetical protein  31.11 
 
 		 168 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0365  hypothetical protein  27.85 
 
 		 263 aa  52  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5003  hypothetical protein  28.81 
 
 		 172 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.468369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2783  hypothetical protein  30 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347405  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>