49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1181 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1181  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  343  5e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.406635  hitchhiker  0.00458574 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2844  conserved hypothetical protein  48.85 
 
 
149 aa  136  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00765  hypothetical protein  48.85 
 
 
160 aa  136  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00782  hypothetical protein  48.85 
 
 
160 aa  136  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2845  hypothetical protein  48.85 
 
 
149 aa  136  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.063186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0854  hypothetical protein  48.85 
 
 
160 aa  136  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2448  hypothetical protein  46.56 
 
 
146 aa  124  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2554  hypothetical protein  48.09 
 
 
160 aa  122  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0865  hypothetical protein  48.85 
 
 
160 aa  122  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0354  hypothetical protein  47.33 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000171392  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3165  hypothetical protein  43.28 
 
 
155 aa  118  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2289  hypothetical protein  40.69 
 
 
157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1696  hypothetical protein  38.93 
 
 
142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0575621  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0270  hypothetical protein  44.03 
 
 
157 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677549 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1897  hypothetical protein  41.22 
 
 
157 aa  104  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2797  hypothetical protein  39.69 
 
 
150 aa  104  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.744208  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1731  hypothetical protein  38.17 
 
 
142 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.365921  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1431  hypothetical protein  41.98 
 
 
144 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.130187  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0433  hypothetical protein  38.73 
 
 
161 aa  101  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2102  hypothetical protein  38.85 
 
 
150 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2146  hypothetical protein  38.85 
 
 
150 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.657037 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35648  predicted protein  34.18 
 
 
169 aa  83.6  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000129267  normal  0.75627 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07041  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000986  uncharacterized domain/GTP cyclohydrolase II  32.81 
 
 
353 aa  77.8  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3050  hypothetical protein  34.31 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60590  hypothetical protein  29.86 
 
 
184 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0405  hypothetical protein  32.23 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3371  hypothetical protein  32.37 
 
 
219 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000316339  unclonable  1.45401e-17 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4523  hypothetical protein  28.47 
 
 
189 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.584646 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4804  hypothetical protein  29.41 
 
 
207 aa  60.8  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5761  hypothetical protein  28.57 
 
 
193 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000051993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2401  hypothetical protein  29.79 
 
 
192 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.135537 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3361  hypothetical protein  31.03 
 
 
187 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.09095  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5219  hypothetical protein  29.17 
 
 
180 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1821  hypothetical protein  30.5 
 
 
182 aa  57.4  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.758753  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1771  hypothetical protein  30.43 
 
 
217 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3505  hypothetical protein  27.78 
 
 
173 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.42017  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0074  hypothetical protein  27.78 
 
 
182 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2199  hypothetical protein  28.97 
 
 
184 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3211  hypothetical protein  29.46 
 
 
336 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0385852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5873  hypothetical protein  29.17 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0750  hypothetical protein  25 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248432  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2006  hypothetical protein  27.08 
 
 
287 aa  50.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.436059  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0288  hypothetical protein  24.84 
 
 
199 aa  48.5  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213851  normal  0.0255605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2927  hypothetical protein  24.83 
 
 
201 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0506294  normal  0.0176003 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2022  hypothetical protein  26.9 
 
 
286 aa  45.4  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0152  hypothetical protein  23.81 
 
 
183 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0120146  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0151  hypothetical protein  24.14 
 
 
197 aa  44.7  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0008  hypothetical protein  23.4 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>