53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3505 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3505  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  345  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.42017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5873  hypothetical protein  64.42 
 
 
168 aa  208  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5761  hypothetical protein  63.12 
 
 
193 aa  204  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000051993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2401  hypothetical protein  63.35 
 
 
192 aa  194  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.135537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5219  hypothetical protein  58.64 
 
 
180 aa  194  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60590  hypothetical protein  58.64 
 
 
184 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1821  hypothetical protein  55 
 
 
182 aa  186  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.758753  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3361  hypothetical protein  53.94 
 
 
187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.09095  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2199  hypothetical protein  52.41 
 
 
184 aa  178  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0750  hypothetical protein  48.75 
 
 
175 aa  177  5.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248432  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4523  hypothetical protein  55.83 
 
 
189 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.584646 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0151  hypothetical protein  45.12 
 
 
197 aa  166  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0008  hypothetical protein  41.72 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0152  hypothetical protein  43.37 
 
 
183 aa  160  9e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2927  hypothetical protein  51.81 
 
 
201 aa  150  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0506294  normal  0.0176003 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2022  hypothetical protein  47.83 
 
 
286 aa  151  5.9999999999999996e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0074  hypothetical protein  43.56 
 
 
182 aa  143  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0365  hypothetical protein  38.65 
 
 
263 aa  139  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3136  hypothetical protein  46.04 
 
 
165 aa  136  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2006  hypothetical protein  41.67 
 
 
287 aa  132  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.436059  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5003  hypothetical protein  47.92 
 
 
172 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.468369 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6789  hypothetical protein  46.1 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2783  hypothetical protein  60.82 
 
 
114 aa  110  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347405  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1970  hypothetical protein  58.54 
 
 
251 aa  98.6  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611932  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0270  hypothetical protein  32.87 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677549 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07041  hypothetical protein  31.69 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000986  uncharacterized domain/GTP cyclohydrolase II  31.69 
 
 
353 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06052  conserved hypothetical protein  33.66 
 
 
732 aa  61.6  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0354  hypothetical protein  31.47 
 
 
148 aa  60.8  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000171392  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3165  hypothetical protein  31.94 
 
 
155 aa  60.1  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2448  hypothetical protein  30 
 
 
146 aa  58.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1181  hypothetical protein  27.78 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.406635  hitchhiker  0.00458574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0405  hypothetical protein  32.61 
 
 
168 aa  57.4  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2845  hypothetical protein  31.62 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.063186 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2844  conserved hypothetical protein  31.62 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00782  hypothetical protein  31.62 
 
 
160 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00765  hypothetical protein  31.62 
 
 
160 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0854  hypothetical protein  31.62 
 
 
160 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2289  hypothetical protein  30.77 
 
 
157 aa  55.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1897  hypothetical protein  33.86 
 
 
157 aa  54.7  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2554  hypothetical protein  31.68 
 
 
160 aa  52.4  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0433  hypothetical protein  34.48 
 
 
161 aa  52.4  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0865  hypothetical protein  31.68 
 
 
160 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1431  hypothetical protein  34.27 
 
 
144 aa  52.4  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.130187  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2797  hypothetical protein  33.81 
 
 
150 aa  51.2  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.744208  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2102  hypothetical protein  32.21 
 
 
150 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2146  hypothetical protein  32.21 
 
 
150 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.657037 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1696  hypothetical protein  28.12 
 
 
142 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0575621  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3050  hypothetical protein  28.66 
 
 
170 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1731  hypothetical protein  27.5 
 
 
142 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.365921  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4804  hypothetical protein  28.32 
 
 
207 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0288  hypothetical protein  28.49 
 
 
199 aa  42.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213851  normal  0.0255605 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35648  predicted protein  27.39 
 
 
169 aa  41.2  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000129267  normal  0.75627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>