178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1136 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1136  protein of unknown function DUF55  100 
 
 		 137 aa  285  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0115295  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2173  hypothetical protein  89.78 
 
 		 137 aa  261  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0742  protein of unknown function DUF55  83.09 
 
 		 140 aa  241  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0729  hypothetical protein  83.09 
 
 		 140 aa  241  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.580961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1748  hypothetical protein  81.75 
 
 		 138 aa  241  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0702  protein of unknown function DUF55  83.82 
 
 		 139 aa  240  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.807504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0926  protein of unknown function DUF55  72.26 
 
 		 139 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3218  hypothetical protein  68.89 
 
 		 144 aa  204  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1108  hypothetical protein  65.69 
 
 		 163 aa  195  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0254  protein of unknown function DUF55  64.23 
 
 		 137 aa  186  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049773  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0472  hypothetical protein  62.77 
 
 		 137 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.904612  normal  0.134048 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0044  hypothetical protein  62.04 
 
 		 137 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0317  hypothetical protein  60.58 
 
 		 137 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0164  hypothetical protein  63.5 
 
 		 141 aa  180  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1512  hypothetical protein  63.5 
 
 		 137 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0559  hypothetical protein  61.31 
 
 		 137 aa  179  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1341  hypothetical protein  59.12 
 
 		 141 aa  178  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000414601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0291  hypothetical protein  59.12 
 
 		 137 aa  176  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0468  hypothetical protein  59.85 
 
 		 137 aa  175  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2917  hypothetical protein  61.31 
 
 		 137 aa  174  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673011  normal  0.0896051 
 
 
-
 
NC_004310  BR1891  hypothetical protein  58.39 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1819  hypothetical protein  58.39 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0710947  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2001  hypothetical protein  55.88 
 
 		 141 aa  169  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3412  protein of unknown function DUF55  59.85 
 
 		 139 aa  168  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2832  hypothetical protein  57.78 
 
 		 140 aa  166  9e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4077  hypothetical protein  58.39 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3206  hypothetical protein  56.2 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162762  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2962  hypothetical protein  57.97 
 
 		 143 aa  163  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.481941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3573  hypothetical protein  57.66 
 
 		 135 aa  163  8e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612442  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0971  hypothetical protein  56.2 
 
 		 144 aa  163  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3695  protein of unknown function DUF55  55.8 
 
 		 143 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4016  protein of unknown function DUF55  55.07 
 
 		 143 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4141  hypothetical protein  57.25 
 
 		 143 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0060  hypothetical protein  53.28 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2937  protein of unknown function DUF55  55.88 
 
 		 138 aa  155  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.362763 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2850  hypothetical protein  54.74 
 
 		 137 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0082  hypothetical protein  44.12 
 
 		 135 aa  127  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2368  hypothetical protein  45.52 
 
 		 142 aa  124  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.864843  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5451  protein of unknown function DUF55  47.41 
 
 		 137 aa  124  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.794452 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1331  hypothetical protein  48.51 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00023234  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1317  hypothetical protein  48.89 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559236  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1261  protein of unknown function DUF55  45.86 
 
 		 139 aa  121  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.673781 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1041  hypothetical protein  49.62 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2489  hypothetical protein  44.03 
 
 		 142 aa  120  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0016498  normal  0.0588103 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0059  hypothetical protein  47.45 
 
 		 154 aa  120  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0064  protein of unknown function DUF55  46.72 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0061  hypothetical protein  45.99 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.177861  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0076  protein of unknown function DUF55  46.72 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0266  protein of unknown function DUF55  45.03 
 
 		 173 aa  116  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.252089  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0926  hypothetical protein  39.26 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1217  protein of unknown function DUF55  45.93 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.02485  hitchhiker  0.000132613 
 
 
-
 
NC_002978  WD0724  hypothetical protein  42.34 
 
 		 132 aa  114  3e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.142066  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3446  hypothetical protein  43.79 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271189  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0705  hypothetical protein  45.19 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0251  protein of unknown function DUF55  43.05 
 
 		 156 aa  110  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0242  protein of unknown function DUF55  40.6 
 
 		 138 aa  110  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0087907  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2275  hypothetical protein  44.37 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1154  hypothetical protein  38.52 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.306462  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0815  hypothetical protein  38 
 
 		 160 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.422094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1357  hypothetical protein  39.74 
 
 		 155 aa  106  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000263938  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2222  protein of unknown function DUF55  41.91 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.155182 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2983  protein of unknown function DUF55  38.19 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.394198 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0509  hypothetical protein  36.42 
 
 		 152 aa  103  7e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000393887  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2363  hypothetical protein  44 
 
 		 158 aa  102  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3975  protein of unknown function DUF55  40.54 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.644317  normal  0.0207421 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2115  hypothetical protein  42.11 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596924 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1642  hypothetical protein  35.76 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  7.18563e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3212  hypothetical protein  39.47 
 
 		 156 aa  100  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1573  hypothetical protein  37.91 
 
 		 156 aa  98.6  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000165437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2738  protein of unknown function DUF55  37.25 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10704  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1312  hypothetical protein  38.82 
 
 		 165 aa  98.6  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.29751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3129  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  38.82 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1030  protein of unknown function DUF55  36.18 
 
 		 160 aa  94.4  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1180  hypothetical protein  37.5 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2287  hypothetical protein  36.84 
 
 		 153 aa  93.6  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000164575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2359  hypothetical protein  36.84 
 
 		 153 aa  93.6  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000352986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2907  hypothetical protein  35.81 
 
 		 152 aa  94  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3142  hypothetical protein  38.1 
 
 		 152 aa  93.6  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2477  hypothetical protein  36.18 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0301106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1486  hypothetical protein  37.69 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2609  hypothetical protein  39.19 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2026  hypothetical protein  37.33 
 
 		 189 aa  90.5  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.661768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2537  hypothetical protein  37.5 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  0.0651387 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2318  protein of unknown function DUF55  38.26 
 
 		 158 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0037  hypothetical protein  32.67 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5266  hypothetical protein  38 
 
 		 153 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561565  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1969  hypothetical protein  36.84 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1737  protein of unknown function DUF55  38.51 
 
 		 153 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000864721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2723  hypothetical protein  38.51 
 
 		 153 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.218147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2648  hypothetical protein  38.51 
 
 		 153 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5205  hypothetical protein  37.33 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5113  hypothetical protein  38.41 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.839421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3203  protein of unknown function DUF55  36.05 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1677  hypothetical protein  37.16 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0319  hypothetical protein  37.33 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00302  hypothetical protein  37.16 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0496  protein of unknown function DUF55  35.07 
 
 		 132 aa  84.7  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.587964  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0353  hypothetical protein  35.1 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0170  protein of unknown function DUF55  38.21 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2149  hypothetical protein  35.81 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>