178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3206 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3206  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  295  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162762  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1891  hypothetical protein  73.19 
 
 
142 aa  222  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1819  hypothetical protein  73.19 
 
 
142 aa  222  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0710947  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0060  hypothetical protein  72.99 
 
 
142 aa  218  1.9999999999999999e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0971  hypothetical protein  72.46 
 
 
144 aa  217  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2832  hypothetical protein  72.59 
 
 
140 aa  212  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1512  hypothetical protein  69.34 
 
 
137 aa  201  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0164  hypothetical protein  69.34 
 
 
141 aa  202  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2962  hypothetical protein  64.79 
 
 
143 aa  201  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.481941  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3412  protein of unknown function DUF55  65.94 
 
 
139 aa  200  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132412  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2917  hypothetical protein  67.15 
 
 
137 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673011  normal  0.0896051 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4077  hypothetical protein  67.15 
 
 
137 aa  196  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1341  hypothetical protein  65.25 
 
 
141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000414601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4016  protein of unknown function DUF55  63.38 
 
 
143 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2001  hypothetical protein  66.91 
 
 
141 aa  193  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4141  hypothetical protein  64.08 
 
 
143 aa  192  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3695  protein of unknown function DUF55  62.68 
 
 
143 aa  190  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0702  protein of unknown function DUF55  57.97 
 
 
139 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.807504  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0742  protein of unknown function DUF55  58.09 
 
 
140 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0729  hypothetical protein  58.09 
 
 
140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.580961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1748  hypothetical protein  56.93 
 
 
138 aa  169  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2173  hypothetical protein  55.47 
 
 
137 aa  166  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1136  protein of unknown function DUF55  56.2 
 
 
137 aa  165  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0115295  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0926  protein of unknown function DUF55  55.4 
 
 
139 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0468  hypothetical protein  54.74 
 
 
137 aa  163  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0559  hypothetical protein  54.01 
 
 
137 aa  161  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0291  hypothetical protein  53.28 
 
 
137 aa  158  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1108  hypothetical protein  53.28 
 
 
163 aa  156  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0472  hypothetical protein  51.09 
 
 
137 aa  153  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.904612  normal  0.134048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0317  hypothetical protein  51.09 
 
 
137 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0044  hypothetical protein  50.36 
 
 
137 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0254  protein of unknown function DUF55  51.09 
 
 
137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049773  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3218  hypothetical protein  53.33 
 
 
144 aa  149  8.999999999999999e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3573  hypothetical protein  51.82 
 
 
135 aa  144  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612442  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2937  protein of unknown function DUF55  50 
 
 
138 aa  144  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.362763 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2850  hypothetical protein  50.36 
 
 
137 aa  144  6e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3446  hypothetical protein  50.33 
 
 
156 aa  141  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271189  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0251  protein of unknown function DUF55  45.7 
 
 
156 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0266  protein of unknown function DUF55  45.7 
 
 
173 aa  130  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.252089  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0724  hypothetical protein  45.93 
 
 
132 aa  127  6e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.142066  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0509  hypothetical protein  46.36 
 
 
152 aa  127  6e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000393887  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2983  protein of unknown function DUF55  45.27 
 
 
155 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.394198 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1261  protein of unknown function DUF55  50 
 
 
139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.673781 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1642  hypothetical protein  45.7 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  7.18563e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0082  hypothetical protein  45.59 
 
 
135 aa  124  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3212  hypothetical protein  43.42 
 
 
156 aa  124  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2222  protein of unknown function DUF55  46.32 
 
 
147 aa  124  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.155182 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2363  hypothetical protein  43.42 
 
 
158 aa  123  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1573  hypothetical protein  45.75 
 
 
156 aa  122  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000165437  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2275  hypothetical protein  43.71 
 
 
163 aa  120  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5451  protein of unknown function DUF55  44.6 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.794452 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2537  hypothetical protein  43.95 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  0.0651387 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1969  hypothetical protein  45.39 
 
 
153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2115  hypothetical protein  42.22 
 
 
138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.596924 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0815  hypothetical protein  44 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.422094  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3975  protein of unknown function DUF55  44.37 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.644317  normal  0.0207421 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2738  protein of unknown function DUF55  40.52 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10704  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2489  hypothetical protein  41.91 
 
 
142 aa  114  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0016498  normal  0.0588103 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1217  protein of unknown function DUF55  46.67 
 
 
137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.02485  hitchhiker  0.000132613 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2287  hypothetical protein  44.08 
 
 
153 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000164575  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2359  hypothetical protein  44.08 
 
 
153 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000352986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0076  protein of unknown function DUF55  44.03 
 
 
146 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0064  protein of unknown function DUF55  44.03 
 
 
146 aa  113  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0059  hypothetical protein  43.15 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2477  hypothetical protein  43.42 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0301106  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2609  hypothetical protein  45.03 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1677  hypothetical protein  43.71 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1312  hypothetical protein  39.1 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.29751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0061  hypothetical protein  42.54 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.177861  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2368  hypothetical protein  40 
 
 
142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.864843  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3142  hypothetical protein  40.67 
 
 
152 aa  110  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1737  protein of unknown function DUF55  44.37 
 
 
153 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000864721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2723  hypothetical protein  44.37 
 
 
153 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.218147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2648  hypothetical protein  44.37 
 
 
153 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2907  hypothetical protein  42.76 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1154  hypothetical protein  39.26 
 
 
135 aa  108  3e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.306462  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1357  hypothetical protein  41.18 
 
 
155 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000263938  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2318  protein of unknown function DUF55  42.28 
 
 
158 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0926  hypothetical protein  39.26 
 
 
135 aa  106  1e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0697  protein of unknown function DUF55  42.28 
 
 
155 aa  106  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3129  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  40.13 
 
 
150 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2196  hypothetical protein  35.53 
 
 
150 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1030  protein of unknown function DUF55  37.5 
 
 
160 aa  105  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0037  hypothetical protein  38.93 
 
 
157 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1853  protein of unknown function DUF55  35.53 
 
 
150 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.890211  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0319  hypothetical protein  41.33 
 
 
149 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0353  hypothetical protein  41.72 
 
 
152 aa  104  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1331  hypothetical protein  38.24 
 
 
147 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00023234  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0242  protein of unknown function DUF55  36.09 
 
 
138 aa  101  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0087907  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2770  protein of unknown function DUF55  43.31 
 
 
152 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0051852  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2323  hypothetical protein  38.96 
 
 
155 aa  101  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.300007  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5205  hypothetical protein  40.67 
 
 
149 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3203  protein of unknown function DUF55  40.4 
 
 
153 aa  100  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0705  hypothetical protein  42.19 
 
 
133 aa  100  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5440  hypothetical protein  40 
 
 
149 aa  100  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5972  hypothetical protein  41.33 
 
 
152 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4260  protein of unknown function DUF55  40.67 
 
 
149 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2149  hypothetical protein  40.14 
 
 
149 aa  98.6  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4320  protein of unknown function DUF55  40.67 
 
 
149 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000124301  hitchhiker  0.00573912 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00302  hypothetical protein  40.51 
 
 
156 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>