23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1379 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1379  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  265  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.18612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  94.92 
 
 		 355 aa  234  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1131  hypothetical protein  63.55 
 
 		 171 aa  149  8.999999999999999e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.907939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  52.07 
 
 		 355 aa  135  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2702  hypothetical protein  51.24 
 
 		 196 aa  130  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  32 
 
 		 355 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  35.51 
 
 		 368 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  35.35 
 
 		 341 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  42.31 
 
 		 350 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  41.18 
 
 		 355 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  31.07 
 
 		 357 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  26.26 
 
 		 355 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  27.27 
 
 		 355 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2699  hypothetical protein  38.46 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2624  hypothetical protein  38.46 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0319312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 		 341 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 		 341 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  43.14 
 
 		 355 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  34.58 
 
 		 368 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  32.71 
 
 		 356 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  30.69 
 
 		 214 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  35.45 
 
 		 370 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  30.56 
 
 		 368 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>