46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0382 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0382  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  100 
 
 
71 aa  146  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20190  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.36 
 
 
228 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1368  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.24 
 
 
102 aa  49.7  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1407  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.19 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117941  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4918  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.9 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1480  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.24 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0221448  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1377  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  51.28 
 
 
99 aa  47.8  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0642  hypothetical protein  53.85 
 
 
96 aa  47  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000446232  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1487  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  53.33 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645872  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2896  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.82 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.543418 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2786  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.44 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000094081  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3424  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  45.24 
 
 
98 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2564  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.22 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.63579  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1542  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.86 
 
 
373 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000135778  unclonable  0.000000000156625 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4027  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.6 
 
 
101 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0921  hypothetical protein  40.82 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3643  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.38 
 
 
95 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0160538  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4131  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0937778  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1291  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1669  addiction module antidote protein  44.44 
 
 
101 aa  43.9  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0533  virulence-associated protein I  44.44 
 
 
103 aa  43.9  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.888429  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2492  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36 
 
 
368 aa  42.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3070  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.82 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314371  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1672  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.43 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4756  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.29 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42030  antitoxin protein  42.31 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4148  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.84 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287171  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2693  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  38.46 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1754  virulence-associated protein, putative  39.53 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0614542  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4828  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.84 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0947  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.42 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.48 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0579  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.84 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4141  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  48.84 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267642  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0415  putative plasmid maintenance system antidote protein VapI  37.04 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0672  plasmid maintenance system antidote protein  42.86 
 
 
171 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.15068  normal  0.669698 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2031  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.86 
 
 
106 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03903  addiction module antidote protein, HigA family  43.59 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2829  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.46 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0896969  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5378  addiction module antidote protein  41.86 
 
 
101 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61840  putative virulence-associated protein  41.86 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2764  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.46 
 
 
95 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3243  plasmid maintenance system antidote protein  38.1 
 
 
102 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0211861  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1093  hypothetical protein  36.17 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1216  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.51 
 
 
101 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2505  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35 
 
 
103 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000574166  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>