More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0216 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_34960  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  56.23 
 
 		 589 aa  656    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1750  asparagine synthetase  55.96 
 
 		 595 aa  659    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0957205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5099  asparagine synthase family amidotransferase  54.24 
 
 		 594 aa  644    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0860  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.76 
 
 		 594 aa  640    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0424562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3188  asparagine synthase amidotransferase  58.63 
 
 		 589 aa  714    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5018  asparagine synthase family amidotransferase  56.93 
 
 		 593 aa  680    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.197798  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1633  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  55.41 
 
 		 590 aa  654    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1342  asparagine synthase amidotransferase  55.96 
 
 		 595 aa  658    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371916  normal  0.923546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2293  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  56.91 
 
 		 593 aa  675    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00195658  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4066  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  56.64 
 
 		 601 aa  667    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3747  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  55.24 
 
 		 590 aa  650    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0137323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7206  putative asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  55.73 
 
 		 569 aa  636    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3964  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  56.29 
 
 		 595 aa  660    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.414023  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4100  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  55.11 
 
 		 590 aa  660    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0816  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.33 
 
 		 590 aa  701    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.816546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3642  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.93 
 
 		 591 aa  722    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4868  asparagine synthase amidotransferase  57.96 
 
 		 589 aa  705    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5353  asparagine synthase family amidotransferase  57.79 
 
 		 589 aa  702    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1989  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  57.6 
 
 		 591 aa  689    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0142  asparagine synthase family amidotransferase  58.46 
 
 		 590 aa  702    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0588532  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0114  asparagine synthase family amidotransferase  56.47 
 
 		 592 aa  677    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3531  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  57.31 
 
 		 596 aa  682    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0213452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2910  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  57.64 
 
 		 594 aa  678    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1300  asparagine synthase amidotransferase  56.46 
 
 		 595 aa  662    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3766  asparagine synthase family amidotransferase  54.35 
 
 		 599 aa  641    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2038  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.64 
 
 		 601 aa  690    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2962  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.53 
 
 		 600 aa  723    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.471232  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2055  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  58.64 
 
 		 601 aa  690    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.559869  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  59.77 
 
 		 591 aa  739    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3398  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  56.67 
 
 		 594 aa  663    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108074  normal  0.978255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5410  asparagine synthase family amidotransferase  56.95 
 
 		 589 aa  684    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2680  asparagine synthase amidotransferase  57.96 
 
 		 590 aa  711    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0122276  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0917  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.92 
 
 		 594 aa  647    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.228251 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2101  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.64 
 
 		 601 aa  690    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.994358  normal  0.105785 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0216  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  100 
 
 		 598 aa  1235    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2276  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  57.55 
 
 		 601 aa  682    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.315443  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1668  asparagine synthase  56.78 
 
 		 589 aa  632  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169203  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19370  putative asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  57.43 
 
 		 589 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.826487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2955  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.31 
 
 		 589 aa  627  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0385583 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3652  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  54.49 
 
 		 595 aa  626  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2461  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  52.42 
 
 		 593 aa  614  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828988  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3038  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.44 
 
 		 590 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2541  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.77 
 
 		 621 aa  605  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.800468  normal  0.489677 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4494  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.38 
 
 		 610 aa  604  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0595  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  50.99 
 
 		 602 aa  596  1e-169  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.957745  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3771  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  53.19 
 
 		 598 aa  595  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.452374  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2728  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  52.93 
 
 		 593 aa  593  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.206697 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0060  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  51.17 
 
 		 588 aa  582  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.58042 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1756  asparagine synthase family amidotransferase  50.17 
 
 		 594 aa  580  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0742  asparagine synthase family amidotransferase  50.17 
 
 		 592 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1119  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing  31.58 
 
 		 632 aa  311  2e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.92 
 
 		 633 aa  311  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641496  normal  0.029694 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0896  asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing]  31.42 
 
 		 632 aa  311  2.9999999999999997e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3584  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.06 
 
 		 628 aa  308  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01303  Asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.24 
 
 		 632 aa  307  4.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2408  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.4 
 
 		 635 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2515  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  33.23 
 
 		 643 aa  306  7e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0685531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6500  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.28 
 
 		 638 aa  306  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0346  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.55 
 
 		 610 aa  304  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0138  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.18 
 
 		 631 aa  302  9e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0809158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0058  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  32.15 
 
 		 629 aa  302  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1389  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.49 
 
 		 625 aa  300  7e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1975  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.29 
 
 		 643 aa  298  3e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0665  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.14 
 
 		 623 aa  296  6e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0824019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4005  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.72 
 
 		 622 aa  296  7e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1194  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.66 
 
 		 634 aa  295  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2466  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.47 
 
 		 625 aa  293  4e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0230  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.7 
 
 		 658 aa  293  6e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1580  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.95 
 
 		 634 aa  292  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0292  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.31 
 
 		 639 aa  291  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.216365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0669  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.67 
 
 		 641 aa  290  4e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2050  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.86 
 
 		 592 aa  290  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1512  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.5 
 
 		 637 aa  289  1e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386079  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4592  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.4 
 
 		 645 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.65001  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0536  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.88 
 
 		 662 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4039  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.29 
 
 		 633 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354675  normal  0.528504 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.78 
 
 		 633 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000126358  unclonable  6.2854299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.93 
 
 		 633 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000133092  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0905  asparagine synthetase family protein  31.14 
 
 		 637 aa  283  7.000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.62 
 
 		 633 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.62 
 
 		 633 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000747097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  31.62 
 
 		 633 aa  282  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000174005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  31.62 
 
 		 633 aa  282  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000200713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.62 
 
 		 633 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000160892  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.62 
 
 		 633 aa  282  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.62 
 
 		 633 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5791  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.18 
 
 		 627 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.2 
 
 		 629 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0712  putative asparagine synthetase  31.13 
 
 		 626 aa  281  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0671  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.33 
 
 		 619 aa  281  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403127  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4439  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.02 
 
 		 634 aa  280  8e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1110  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.36 
 
 		 637 aa  279  1e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2864  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.82 
 
 		 678 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.113141  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1778  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.38 
 
 		 629 aa  277  5e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2057  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.81 
 
 		 603 aa  277  5e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.825399  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4478  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.44 
 
 		 666 aa  276  8e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.48246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.03 
 
 		 629 aa  276  9e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411872  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0461  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.07 
 
 		 613 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2956  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.66 
 
 		 678 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0200  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  29.47 
 
 		 655 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>