28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3336 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3274  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  344  4e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3336  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  344  4e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215963  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3285  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  344  4e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2970  hypothetical protein  93.04 
 
 
159 aa  308  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3541  hypothetical protein  86.16 
 
 
163 aa  289  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367378  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12207  hypothetical protein  79.25 
 
 
168 aa  267  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3038  hypothetical protein  74.03 
 
 
160 aa  223  7e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24810  hypothetical protein  64.78 
 
 
174 aa  211  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.217798  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2673  hypothetical protein  66.88 
 
 
158 aa  203  7e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1393  hypothetical protein  60.13 
 
 
170 aa  202  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20125  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3268  hypothetical protein  62.58 
 
 
168 aa  201  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.200062  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3498  hypothetical protein  61.96 
 
 
180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.617159  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3226  hypothetical protein  64.94 
 
 
183 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000197363  hitchhiker  0.000025689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5051  hypothetical protein  57.5 
 
 
169 aa  189  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.181832 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3322  hypothetical protein  64.15 
 
 
161 aa  187  7e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164053  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1831  hypothetical protein  61.49 
 
 
178 aa  176  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3086  hypothetical protein  54.66 
 
 
176 aa  176  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0020  hypothetical protein  33.52 
 
 
194 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2940  hypothetical protein  44.58 
 
 
172 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0954195  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6145  hypothetical protein  41.1 
 
 
144 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4809  hypothetical protein  36.99 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.758684  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6925  hypothetical protein  42.59 
 
 
172 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.64306  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3183  hypothetical protein  44.44 
 
 
241 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000722228 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4982  hypothetical protein  42.59 
 
 
172 aa  48.5  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42162  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2831  hypothetical protein  42.59 
 
 
240 aa  47.8  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5020  hypothetical protein  27.45 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.788021  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4977  hypothetical protein  43.64 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2129  hypothetical protein  34.12 
 
 
150 aa  40.8  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207375  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>