25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3268 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3268  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  338  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.200062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3498  hypothetical protein  91.62 
 
 		 180 aa  314  4e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.617159  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5051  hypothetical protein  72.84 
 
 		 169 aa  251  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.181832 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3322  hypothetical protein  74.39 
 
 		 161 aa  221  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164053  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24810  hypothetical protein  66.67 
 
 		 174 aa  221  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.217798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1393  hypothetical protein  66.67 
 
 		 170 aa  216  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20125  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3226  hypothetical protein  63.52 
 
 		 183 aa  204  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000197363  hitchhiker  0.000025689 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3274  hypothetical protein  62.58 
 
 		 168 aa  201  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3336  hypothetical protein  62.58 
 
 		 168 aa  201  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215963  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3285  hypothetical protein  62.58 
 
 		 168 aa  201  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2970  hypothetical protein  60.25 
 
 		 159 aa  190  9e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2673  hypothetical protein  61.73 
 
 		 158 aa  186  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3086  hypothetical protein  59.88 
 
 		 176 aa  186  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12207  hypothetical protein  59.26 
 
 		 168 aa  185  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3541  hypothetical protein  58.02 
 
 		 163 aa  185  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367378  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1831  hypothetical protein  62.5 
 
 		 178 aa  182  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3038  hypothetical protein  62.42 
 
 		 160 aa  179  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0020  hypothetical protein  36.52 
 
 		 194 aa  120  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2940  hypothetical protein  42.86 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0954195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6145  hypothetical protein  37.65 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2831  hypothetical protein  38.96 
 
 		 240 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3183  hypothetical protein  38.96 
 
 		 241 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000722228 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4809  hypothetical protein  32.95 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.758684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4982  hypothetical protein  39.34 
 
 		 172 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42162  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6925  hypothetical protein  35.53 
 
 		 172 aa  41.2  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.64306  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>