20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1831 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1831  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  359  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3086  hypothetical protein  81.07 
 
 
176 aa  278  3e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24810  hypothetical protein  67.63 
 
 
174 aa  216  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.217798  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1393  hypothetical protein  66.27 
 
 
170 aa  207  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20125  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5051  hypothetical protein  61.08 
 
 
169 aa  201  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.181832 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3498  hypothetical protein  61.41 
 
 
180 aa  194  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.617159  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3268  hypothetical protein  62.5 
 
 
168 aa  191  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.200062  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3541  hypothetical protein  61.88 
 
 
163 aa  190  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367378  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3285  hypothetical protein  61.49 
 
 
168 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3336  hypothetical protein  61.49 
 
 
168 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215963  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3274  hypothetical protein  61.49 
 
 
168 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3038  hypothetical protein  67.74 
 
 
160 aa  188  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3322  hypothetical protein  67.92 
 
 
161 aa  187  9e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164053  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2970  hypothetical protein  60.25 
 
 
159 aa  186  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12207  hypothetical protein  60.87 
 
 
168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3226  hypothetical protein  61.01 
 
 
183 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000197363  hitchhiker  0.000025689 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2673  hypothetical protein  64.6 
 
 
158 aa  169  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2940  hypothetical protein  46.75 
 
 
172 aa  125  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0954195  normal 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0020  hypothetical protein  37.7 
 
 
194 aa  121  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6145  hypothetical protein  37.21 
 
 
144 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>