22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3086 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3086  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  357  7e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1831  hypothetical protein  81.07 
 
 		 178 aa  262  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24810  hypothetical protein  60.47 
 
 		 174 aa  193  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.217798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1393  hypothetical protein  58.93 
 
 		 170 aa  191  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20125  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3498  hypothetical protein  59.88 
 
 		 180 aa  187  9e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.617159  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5051  hypothetical protein  56.89 
 
 		 169 aa  187  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.181832 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3268  hypothetical protein  59.88 
 
 		 168 aa  186  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.200062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3541  hypothetical protein  55.9 
 
 		 163 aa  177  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367378  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3274  hypothetical protein  54.66 
 
 		 168 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3336  hypothetical protein  54.66 
 
 		 168 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215963  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3285  hypothetical protein  54.66 
 
 		 168 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3038  hypothetical protein  62.58 
 
 		 160 aa  176  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3322  hypothetical protein  62.26 
 
 		 161 aa  176  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164053  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2970  hypothetical protein  54.04 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3226  hypothetical protein  55.7 
 
 		 183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000197363  hitchhiker  0.000025689 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12207  hypothetical protein  54.04 
 
 		 168 aa  167  6e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2673  hypothetical protein  59.75 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2940  hypothetical protein  43.53 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0954195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0020  hypothetical protein  33.85 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2831  hypothetical protein  39.29 
 
 		 240 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3183  hypothetical protein  38.1 
 
 		 241 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000722228 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6145  hypothetical protein  38.37 
 
 		 144 aa  44.7  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>