26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3226 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3226  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000197363  hitchhiker  0.000025689 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24810  hypothetical protein  61.54 
 
 
174 aa  206  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.217798  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3268  hypothetical protein  63.52 
 
 
168 aa  204  5e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.200062  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1393  hypothetical protein  60 
 
 
170 aa  201  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20125  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5051  hypothetical protein  57.93 
 
 
169 aa  199  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.181832 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3498  hypothetical protein  63.52 
 
 
180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.617159  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3336  hypothetical protein  64.94 
 
 
168 aa  195  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215963  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3285  hypothetical protein  64.94 
 
 
168 aa  195  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3274  hypothetical protein  64.94 
 
 
168 aa  195  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12207  hypothetical protein  61.08 
 
 
168 aa  191  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3038  hypothetical protein  65.13 
 
 
160 aa  191  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2970  hypothetical protein  62.34 
 
 
159 aa  189  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3541  hypothetical protein  61.54 
 
 
163 aa  189  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367378  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3322  hypothetical protein  63.87 
 
 
161 aa  185  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164053  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2673  hypothetical protein  63.36 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1831  hypothetical protein  61.01 
 
 
178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3086  hypothetical protein  55.7 
 
 
176 aa  171  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0020  hypothetical protein  37.43 
 
 
194 aa  122  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2940  hypothetical protein  40.12 
 
 
172 aa  108  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0954195  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6145  hypothetical protein  37 
 
 
144 aa  52.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3183  hypothetical protein  38.46 
 
 
241 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000722228 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4809  hypothetical protein  42.86 
 
 
154 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.758684  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2831  hypothetical protein  37.18 
 
 
240 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6925  hypothetical protein  42.59 
 
 
172 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.64306  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4982  hypothetical protein  42.59 
 
 
172 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42162  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4977  hypothetical protein  44.07 
 
 
169 aa  42  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>