25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6925 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6925  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.64306  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4982  hypothetical protein  84.3 
 
 
172 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42162  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2831  hypothetical protein  59.21 
 
 
240 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3183  hypothetical protein  58.55 
 
 
241 aa  173  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000722228 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4809  hypothetical protein  49.66 
 
 
154 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.758684  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6145  hypothetical protein  55.05 
 
 
144 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4977  hypothetical protein  37.66 
 
 
169 aa  80.9  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3038  hypothetical protein  48.15 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0129  hypothetical protein  29.94 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0017929  hitchhiker  0.0000435271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5020  hypothetical protein  36.36 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.788021  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12207  hypothetical protein  44.44 
 
 
168 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2673  hypothetical protein  46.3 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3285  hypothetical protein  42.59 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3336  hypothetical protein  42.59 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215963  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3274  hypothetical protein  42.59 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2970  hypothetical protein  42.59 
 
 
159 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3226  hypothetical protein  42.59 
 
 
183 aa  48.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000197363  hitchhiker  0.000025689 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0020  hypothetical protein  28.25 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3498  hypothetical protein  29.61 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.617159  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24810  hypothetical protein  46.3 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.217798  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1393  hypothetical protein  42.59 
 
 
170 aa  44.3  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20125  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3541  hypothetical protein  38.89 
 
 
163 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367378  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3322  hypothetical protein  44.44 
 
 
161 aa  42  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164053  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3268  hypothetical protein  35.53 
 
 
168 aa  41.2  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.200062  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5051  hypothetical protein  26.97 
 
 
169 aa  41.2  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.181832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>