17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_5020 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_5020  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  302  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.788021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4809  hypothetical protein  35.76 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.758684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6145  hypothetical protein  47.14 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4977  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4982  hypothetical protein  35.06 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42162  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6925  hypothetical protein  45.95 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.64306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2831  hypothetical protein  42.31 
 
 		 240 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3183  hypothetical protein  50.91 
 
 		 241 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000722228 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2673  hypothetical protein  27.54 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0129  hypothetical protein  47.14 
 
 		 190 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0017929  hitchhiker  0.0000435271 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2970  hypothetical protein  26 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3541  hypothetical protein  26 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367378  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1393  hypothetical protein  30 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20125  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3285  hypothetical protein  27.45 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3336  hypothetical protein  27.45 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215963  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3274  hypothetical protein  27.45 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12207  hypothetical protein  28.76 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>