23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4977 on replicon NC_008762
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008762  Pnap_4977  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  352  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4809  hypothetical protein  43.05 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.758684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3183  hypothetical protein  38.71 
 
 		 241 aa  87.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000722228 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4982  hypothetical protein  36.77 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42162  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2831  hypothetical protein  36.13 
 
 		 240 aa  77.8  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6925  hypothetical protein  36.84 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.64306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6145  hypothetical protein  40.62 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0129  hypothetical protein  42.17 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0017929  hitchhiker  0.0000435271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5020  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.788021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3038  hypothetical protein  47.27 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2940  hypothetical protein  28.25 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0954195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0020  hypothetical protein  32.03 
 
 		 194 aa  44.7  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24810  hypothetical protein  47.14 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.217798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2673  hypothetical protein  39.76 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3541  hypothetical protein  43.64 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367378  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3285  hypothetical protein  43.64 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1393  hypothetical protein  47.06 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3336  hypothetical protein  43.64 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215963  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3274  hypothetical protein  43.64 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3498  hypothetical protein  42.25 
 
 		 180 aa  42  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.617159  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2970  hypothetical protein  43.64 
 
 		 159 aa  42  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3226  hypothetical protein  44.07 
 
 		 183 aa  42  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000197363  hitchhiker  0.000025689 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12207  hypothetical protein  45.45 
 
 		 168 aa  41.2  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>