26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4809 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4809  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  319  7e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.758684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3183  hypothetical protein  57.43 
 
 		 241 aa  167  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000722228 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2831  hypothetical protein  56.76 
 
 		 240 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4982  hypothetical protein  48.98 
 
 		 172 aa  131  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42162  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6925  hypothetical protein  47.62 
 
 		 172 aa  123  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.64306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6145  hypothetical protein  59.34 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4977  hypothetical protein  43.05 
 
 		 169 aa  103  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0129  hypothetical protein  30.68 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0017929  hitchhiker  0.0000435271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5020  hypothetical protein  35.76 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.788021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3038  hypothetical protein  43.64 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3336  hypothetical protein  36.99 
 
 		 168 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215963  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3274  hypothetical protein  36.99 
 
 		 168 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3285  hypothetical protein  36.99 
 
 		 168 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3226  hypothetical protein  42.86 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000197363  hitchhiker  0.000025689 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12207  hypothetical protein  36.36 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1393  hypothetical protein  36.36 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20125  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0020  hypothetical protein  29.07 
 
 		 194 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3541  hypothetical protein  35.62 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367378  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2970  hypothetical protein  36.99 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2673  hypothetical protein  43.64 
 
 		 158 aa  47.8  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24810  hypothetical protein  32.11 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.217798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3322  hypothetical protein  42.59 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164053  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3268  hypothetical protein  32.95 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.200062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5051  hypothetical protein  38.6 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.181832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2940  hypothetical protein  29.71 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0954195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1831  hypothetical protein  28.45 
 
 		 178 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>