More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl146 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl146  translation initiation factor IF-1  100 
 
 		 78 aa  159  2e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000119077  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0674  translation initiation factor IF-1  89.19 
 
 		 74 aa  140  6e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  74.29 
 
 		 72 aa  111  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000556493  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0311  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 72 aa  110  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000252323  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1829  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0203  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 72 aa  110  8.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  74.29 
 
 		 72 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2274  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00199811  hitchhiker  0.00298742 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0312  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 83 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120042  unclonable  9.19989e-29 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 72 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2207  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 72 aa  108  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000268658  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  74.29 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  74.29 
 
 		 72 aa  107  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000219097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2146  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 72 aa  105  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000135511  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2401  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000518496  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0729  translation initiation factor IF-1  67.61 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  70.42 
 
 		 73 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0519  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.159478  unclonable  0.0000000000136175 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0349  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0489809  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1912  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  104  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000211647  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1762  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  104  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00307993  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  71.43 
 
 		 85 aa  103  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 75 aa  103  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  102  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2056  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 72 aa  102  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  70 
 
 		 72 aa  103  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2160  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1285  translation initiation factor IF-1  61.33 
 
 		 83 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1346  translation initiation factor IF-1  61.33 
 
 		 83 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1261  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0336  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2598  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  101  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000268171  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  101  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935268  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  101  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1412  translation initiation factor IF-1  67.61 
 
 		 72 aa  100  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.59758e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1446  translation initiation factor 1  62.86 
 
 		 72 aa  100  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.43996  normal  0.245774 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0788  translation initiation factor IF-1  60 
 
 		 72 aa  100  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0427715  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1461  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 72 aa  100  9e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000527108  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01400  translation initiation factor 1  68.57 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0644583  normal  0.998737 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  64.29 
 
 		 73 aa  99.8  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1138  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000117845  normal  0.0449626 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  99  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05825  translation initiation factor IF-1  60 
 
 		 71 aa  99  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2690  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 72 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2375  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 72 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0426  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.249384  normal  0.130241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0588  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 		 73 aa  98.2  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1857  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  97.8  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0737608  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1837  translation initiation factor IF-1  59.15 
 
 		 72 aa  98.2  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0378537  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  97.8  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1916  translation initiation factor IF-1  60 
 
 		 72 aa  97.4  6e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1168  translation initiation factor IF-1  60 
 
 		 71 aa  97.4  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143107  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3317  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 		 72 aa  97.1  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.795368  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0738  translation initiation factor IF-1  67.61 
 
 		 73 aa  97.1  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 72 aa  96.7  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4295  translation initiation factor IF-1  64.71 
 
 		 73 aa  96.3  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0497  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 		 73 aa  96.3  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000154065  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4007  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 		 72 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.676038  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3612  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 		 72 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28260  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 		 72 aa  95.9  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3182  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 		 72 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142859  normal  0.0830693 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02359  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000147738  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2622  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 		 73 aa  95.9  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.378683  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3589  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 		 72 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1826  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 		 72 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.904504  normal  0.0323919 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  65.71 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_440  translation initiation factor 1 (IF-1)  61.43 
 
 		 73 aa  96.3  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000138941  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1113  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 		 73 aa  96.3  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508115  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0959  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 		 73 aa  96.3  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0474  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 		 73 aa  96.3  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000144265  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30240  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 		 72 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2929  translation initiation factor IF-1  60 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204255 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3411  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 		 72 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.209503 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0718  translation initiation factor 1  61.43 
 
 		 87 aa  96.7  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2392  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 		 72 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0071  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.358943  hitchhiker  0.000000000845588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2588  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 		 72 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374819  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1762  translation initiation factor IF-1  60 
 
 		 72 aa  95.5  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2471  translation initiation factor IF-1  60 
 
 		 72 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000828096  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2818  translation initiation factor IF-1  60 
 
 		 72 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196542  normal  0.235424 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0376  translation initiation factor IF-1  55.71 
 
 		 71 aa  95.5  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1578  translation initiation factor IF-1  60 
 
 		 72 aa  95.5  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>