38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3021 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_3021  protein of unknown function DUF309  100 
 
 
110 aa  220  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2066  hypothetical protein  64.55 
 
 
113 aa  145  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.550255  normal  0.580565 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1836  hypothetical protein  51.61 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0073  hypothetical protein  34.65 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1170  protein of unknown function DUF309  39.25 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105059  normal  0.0466669 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2698  hypothetical protein  34.23 
 
 
121 aa  61.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.853504  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1551  protein of unknown function DUF309  28.57 
 
 
133 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1524  protein of unknown function DUF309  29.47 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4640  hypothetical protein  36.56 
 
 
119 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2113  hypothetical protein  38.55 
 
 
129 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.18714  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2505  protein of unknown function DUF309  28.74 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.930715  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2878  hypothetical protein  34.09 
 
 
139 aa  52  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3749  protein of unknown function DUF309  26.36 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.808208 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0515  hypothetical protein  27.88 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1664  hypothetical protein  35.11 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00161452  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0536  hypothetical protein  37.31 
 
 
186 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1756  hypothetical protein  35.71 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.15892  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3375  hypothetical protein  30.61 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.773105 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3140  protein of unknown function DUF309  48.94 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1566  hypothetical protein  28.42 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.358395  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08201  hypothetical protein  34.55 
 
 
128 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1640  hypothetical protein  28.57 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.902049  normal  0.797151 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1235  hypothetical protein  31.25 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2225  protein of unknown function DUF309  31.58 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1147  protein of unknown function DUF309  45.83 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2231  protein of unknown function DUF309  31.11 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4386  hypothetical protein  27.72 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2301  protein of unknown function DUF309  32.99 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16771  hypothetical protein  26.8 
 
 
129 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.368131 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2598  protein of unknown function DUF309  31.18 
 
 
190 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.581057 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2840  protein of unknown function DUF309  29.47 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2144  protein of unknown function DUF309  28.57 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00366421  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1144  hypothetical protein  35.56 
 
 
173 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44042 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2235  protein of unknown function DUF309  32.99 
 
 
204 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08231  hypothetical protein  33.96 
 
 
122 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.603179  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0771  hypothetical protein  32.08 
 
 
122 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.911885  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08251  hypothetical protein  32.08 
 
 
122 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.584511  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2921  hypothetical protein  35.21 
 
 
130 aa  41.2  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>