36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0536 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0536  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  384  1e-106  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1144  hypothetical protein  28.99 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44042 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1331  hypothetical protein  31.62 
 
 
173 aa  63.5  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.80909 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0363  hypothetical protein  33.8 
 
 
172 aa  60.8  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.891025 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2066  hypothetical protein  31.87 
 
 
113 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.550255  normal  0.580565 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0745  hypothetical protein  28.95 
 
 
177 aa  54.3  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.112005 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4640  hypothetical protein  32.14 
 
 
119 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08201  hypothetical protein  31.37 
 
 
128 aa  52  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08251  hypothetical protein  31.4 
 
 
122 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.584511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3911  hypothetical protein  30.56 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3823  hypothetical protein  30.56 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.40568  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3837  hypothetical protein  30.56 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0327669  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0771  hypothetical protein  31.4 
 
 
122 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.911885  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3021  protein of unknown function DUF309  37.31 
 
 
110 aa  50.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08231  hypothetical protein  31.4 
 
 
122 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.603179  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2442  hypothetical protein  31.71 
 
 
131 aa  48.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1566  hypothetical protein  27.55 
 
 
149 aa  46.2  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.358395  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07991  hypothetical protein  24.79 
 
 
126 aa  45.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.17478  normal  0.712316 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1763  hypothetical protein  35.42 
 
 
174 aa  45.4  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2144  protein of unknown function DUF309  31.33 
 
 
135 aa  45.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00366421  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10001  hypothetical protein  29.41 
 
 
137 aa  44.7  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.181557 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1998  hypothetical protein  36.36 
 
 
141 aa  44.3  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141623  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0964  hypothetical protein  28.92 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.543165  normal  0.343587 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1551  protein of unknown function DUF309  26.97 
 
 
133 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  26.09 
 
 
494 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1640  hypothetical protein  26.74 
 
 
126 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.902049  normal  0.797151 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1170  protein of unknown function DUF309  26.88 
 
 
114 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105059  normal  0.0466669 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3749  protein of unknown function DUF309  23.08 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.808208 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1524  protein of unknown function DUF309  26.97 
 
 
133 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16771  hypothetical protein  32.93 
 
 
129 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.368131 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0167  hypothetical protein  25.53 
 
 
126 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0955235  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4845  protein of unknown function DUF309  25 
 
 
156 aa  42  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2235  protein of unknown function DUF309  30.12 
 
 
204 aa  42  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4386  hypothetical protein  25.29 
 
 
132 aa  41.6  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1989  hypothetical protein  26.58 
 
 
184 aa  41.2  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3375  hypothetical protein  32.89 
 
 
137 aa  40.8  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.773105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>