13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1144 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1144  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  350  5e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44042 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1331  hypothetical protein  68.02 
 
 
173 aa  243  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.80909 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0363  hypothetical protein  65.7 
 
 
172 aa  230  6e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.891025 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1763  hypothetical protein  52.6 
 
 
174 aa  154  8e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0745  hypothetical protein  42.61 
 
 
177 aa  124  5e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.112005 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0536  hypothetical protein  28.99 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1711  protein of unknown function DUF309  30.47 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1998  hypothetical protein  39.68 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141623  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2066  hypothetical protein  36.46 
 
 
113 aa  45.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.550255  normal  0.580565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3021  protein of unknown function DUF309  35.56 
 
 
110 aa  42.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1235  hypothetical protein  30.61 
 
 
121 aa  41.6  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1244  hypothetical protein  33.33 
 
 
118 aa  42  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08201  hypothetical protein  29.87 
 
 
128 aa  40.8  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>