16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2840 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2840  protein of unknown function DUF309  100 
 
 
160 aa  330  7.000000000000001e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2301  protein of unknown function DUF309  69.75 
 
 
163 aa  240  5e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2225  protein of unknown function DUF309  72.56 
 
 
164 aa  236  9e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0684  protein of unknown function DUF309  65.5 
 
 
172 aa  229  1e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2598  protein of unknown function DUF309  60.43 
 
 
190 aa  219  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.581057 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2253  protein of unknown function DUF309  36.54 
 
 
204 aa  73.9  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.162204  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0568  protein of unknown function DUF309  37.86 
 
 
202 aa  70.5  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.966823 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0433  protein of unknown function DUF309  35.58 
 
 
204 aa  67  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2235  protein of unknown function DUF309  31.71 
 
 
204 aa  57.4  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4640  hypothetical protein  31.53 
 
 
119 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1630  hypothetical protein  34.21 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.744656  normal  0.821485 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3021  protein of unknown function DUF309  29.47 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2066  hypothetical protein  28.09 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.550255  normal  0.580565 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0515  hypothetical protein  33.77 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0167  hypothetical protein  30 
 
 
126 aa  41.6  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0955235  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07991  hypothetical protein  30 
 
 
126 aa  41.2  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.17478  normal  0.712316 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>