23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2253 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2253  protein of unknown function DUF309  100 
 
 
204 aa  403  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.162204  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0433  protein of unknown function DUF309  73.53 
 
 
204 aa  293  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0568  protein of unknown function DUF309  57.56 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.966823 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2235  protein of unknown function DUF309  47.5 
 
 
204 aa  169  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0116  protein of unknown function DUF309  44.28 
 
 
233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.578937 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2840  protein of unknown function DUF309  36.54 
 
 
160 aa  73.9  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2598  protein of unknown function DUF309  35.58 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.581057 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0684  protein of unknown function DUF309  32.43 
 
 
172 aa  61.6  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2225  protein of unknown function DUF309  33 
 
 
164 aa  58.5  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2301  protein of unknown function DUF309  30.36 
 
 
163 aa  56.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4640  hypothetical protein  33.03 
 
 
119 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08201  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0401  hypothetical protein  32.1 
 
 
140 aa  45.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000990736  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1640  hypothetical protein  25.88 
 
 
126 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.902049  normal  0.797151 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2144  protein of unknown function DUF309  32.89 
 
 
135 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00366421  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08231  hypothetical protein  26.89 
 
 
122 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.603179  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1170  protein of unknown function DUF309  32.63 
 
 
114 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105059  normal  0.0466669 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3749  protein of unknown function DUF309  29.11 
 
 
142 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.808208 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2878  hypothetical protein  32.88 
 
 
139 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2442  hypothetical protein  28.99 
 
 
131 aa  42  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0515  hypothetical protein  30.3 
 
 
140 aa  41.6  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2066  hypothetical protein  38.96 
 
 
113 aa  41.6  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.550255  normal  0.580565 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2505  protein of unknown function DUF309  29.21 
 
 
119 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.930715  normal  0.864397 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>