21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0116 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0116  protein of unknown function DUF309  100 
 
 		 233 aa  457  9.999999999999999e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.578937 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2253  protein of unknown function DUF309  44.28 
 
 		 204 aa  142  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.162204  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0568  protein of unknown function DUF309  43.56 
 
 		 202 aa  138  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.966823 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0433  protein of unknown function DUF309  44.28 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2235  protein of unknown function DUF309  39.02 
 
 		 204 aa  128  8.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2225  protein of unknown function DUF309  32.31 
 
 		 164 aa  52  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3749  protein of unknown function DUF309  30.19 
 
 		 142 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.808208 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1551  protein of unknown function DUF309  31.17 
 
 		 133 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1524  protein of unknown function DUF309  31.17 
 
 		 133 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1566  hypothetical protein  28.41 
 
 		 149 aa  48.5  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.358395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08201  hypothetical protein  23.58 
 
 		 128 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1640  hypothetical protein  34.85 
 
 		 126 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.902049  normal  0.797151 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4386  hypothetical protein  29.25 
 
 		 132 aa  45.8  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2840  protein of unknown function DUF309  30.77 
 
 		 160 aa  45.8  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2598  protein of unknown function DUF309  33.33 
 
 		 190 aa  45.8  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.581057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2505  protein of unknown function DUF309  29.76 
 
 		 119 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.930715  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2442  hypothetical protein  32.61 
 
 		 131 aa  45.4  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2144  protein of unknown function DUF309  34.57 
 
 		 135 aa  42.4  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00366421  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4640  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  42.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0515  hypothetical protein  31.46 
 
 		 140 aa  42  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0684  protein of unknown function DUF309  30.25 
 
 		 172 aa  41.6  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>