20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2598 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2598  protein of unknown function DUF309  100 
 
 
190 aa  379  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.581057 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0684  protein of unknown function DUF309  65.43 
 
 
172 aa  238  2.9999999999999997e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2301  protein of unknown function DUF309  62.11 
 
 
163 aa  228  5e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2840  protein of unknown function DUF309  62.03 
 
 
160 aa  226  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2225  protein of unknown function DUF309  59.04 
 
 
164 aa  210  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2253  protein of unknown function DUF309  35.58 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.162204  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0433  protein of unknown function DUF309  35.58 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0568  protein of unknown function DUF309  34.75 
 
 
202 aa  63.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.966823 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2235  protein of unknown function DUF309  36.63 
 
 
204 aa  60.5  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1630  hypothetical protein  38.36 
 
 
126 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.744656  normal  0.821485 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0167  hypothetical protein  30.11 
 
 
126 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0955235  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07991  hypothetical protein  30.11 
 
 
126 aa  45.1  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.17478  normal  0.712316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2113  hypothetical protein  30.28 
 
 
129 aa  44.7  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.18714  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1170  protein of unknown function DUF309  31.68 
 
 
114 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105059  normal  0.0466669 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1989  hypothetical protein  36.36 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3021  protein of unknown function DUF309  31.18 
 
 
110 aa  42.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4640  hypothetical protein  32.61 
 
 
119 aa  42.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1836  hypothetical protein  32.26 
 
 
112 aa  42.4  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4386  hypothetical protein  28.92 
 
 
132 aa  41.6  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0116  protein of unknown function DUF309  30.77 
 
 
233 aa  41.2  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.578937 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>