31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1836 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1836  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  225  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3021  protein of unknown function DUF309  51.61 
 
 
110 aa  87  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1170  protein of unknown function DUF309  46.39 
 
 
114 aa  73.9  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105059  normal  0.0466669 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2066  hypothetical protein  41.75 
 
 
113 aa  70.1  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.550255  normal  0.580565 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2235  protein of unknown function DUF309  37.5 
 
 
204 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4640  hypothetical protein  38.46 
 
 
119 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0073  hypothetical protein  30.48 
 
 
137 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2698  hypothetical protein  37 
 
 
121 aa  51.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.853504  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2113  hypothetical protein  40.24 
 
 
129 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.18714  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2598  protein of unknown function DUF309  31.91 
 
 
190 aa  50.4  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.581057 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1998  hypothetical protein  37.5 
 
 
141 aa  50.4  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141623  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0536  hypothetical protein  27.06 
 
 
186 aa  49.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1630  hypothetical protein  47.27 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.744656  normal  0.821485 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0568  protein of unknown function DUF309  36.08 
 
 
202 aa  47.8  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.966823 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0433  protein of unknown function DUF309  34.69 
 
 
204 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1756  hypothetical protein  40 
 
 
135 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.15892  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2225  protein of unknown function DUF309  30.85 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2301  protein of unknown function DUF309  28.42 
 
 
163 aa  45.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3140  protein of unknown function DUF309  34.18 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2144  protein of unknown function DUF309  42.86 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00366421  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1147  protein of unknown function DUF309  35.71 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3375  hypothetical protein  43.64 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.773105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1640  hypothetical protein  31.76 
 
 
126 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.902049  normal  0.797151 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0684  protein of unknown function DUF309  27.37 
 
 
172 aa  43.5  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08231  hypothetical protein  35.42 
 
 
122 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.603179  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0771  hypothetical protein  35.42 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.911885  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08251  hypothetical protein  36.17 
 
 
122 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.584511  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08201  hypothetical protein  39.47 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2253  protein of unknown function DUF309  30.51 
 
 
204 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.162204  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1664  hypothetical protein  44.68 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00161452  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2840  protein of unknown function DUF309  27.37 
 
 
160 aa  40.8  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.265897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>