46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2113 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2113  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  267  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.18714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1756  hypothetical protein  78.91 
 
 		 135 aa  209  7.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.15892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1170  protein of unknown function DUF309  53 
 
 		 114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105059  normal  0.0466669 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2698  hypothetical protein  41.75 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.853504  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3021  protein of unknown function DUF309  38.55 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2066  hypothetical protein  34.95 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.550255  normal  0.580565 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3375  hypothetical protein  36.96 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.773105 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1244  hypothetical protein  32.04 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1551  protein of unknown function DUF309  30.12 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1524  protein of unknown function DUF309  30.12 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3749  protein of unknown function DUF309  30.49 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.808208 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0515  hypothetical protein  28.57 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0401  hypothetical protein  34.07 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000990736  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2878  hypothetical protein  34.55 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4386  hypothetical protein  27.59 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4845  protein of unknown function DUF309  36.08 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1640  hypothetical protein  46.51 
 
 		 126 aa  50.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.902049  normal  0.797151 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0073  hypothetical protein  25.24 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1566  hypothetical protein  34.57 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.358395  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1664  hypothetical protein  34.09 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00161452  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1435  protein of unknown function DUF309  32.67 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4640  hypothetical protein  30.68 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2442  hypothetical protein  31.71 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1630  hypothetical protein  33.94 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.744656  normal  0.821485 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1235  hypothetical protein  25 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0167  hypothetical protein  25.88 
 
 		 126 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0955235  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07991  hypothetical protein  25.88 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.17478  normal  0.712316 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16771  hypothetical protein  28.92 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.368131 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2921  hypothetical protein  28.57 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2225  protein of unknown function DUF309  33.33 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3140  protein of unknown function DUF309  28.87 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2144  protein of unknown function DUF309  39.29 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00366421  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2505  protein of unknown function DUF309  24.72 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.930715  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1331  hypothetical protein  42.86 
 
 		 173 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.80909 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2598  protein of unknown function DUF309  30.28 
 
 		 190 aa  44.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.581057 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0206  protein of unknown function DUF309  33.73 
 
 		 180 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1147  protein of unknown function DUF309  29.17 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3837  hypothetical protein  28.57 
 
 		 159 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0327669  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3823  hypothetical protein  28.57 
 
 		 159 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.40568  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3911  hypothetical protein  28.57 
 
 		 159 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2231  protein of unknown function DUF309  32.89 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5496  protein of unknown function DUF309  33.73 
 
 		 185 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000612718  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1836  hypothetical protein  39.29 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10001  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.181557 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0363  hypothetical protein  37.5 
 
 		 172 aa  40  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.891025 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1144  hypothetical protein  39.58 
 
 		 173 aa  40  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44042 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>