64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1147 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1147  protein of unknown function DUF309  100 
 
 		 127 aa  259  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3140  protein of unknown function DUF309  87.4 
 
 		 130 aa  228  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1664  hypothetical protein  57.63 
 
 		 137 aa  139  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00161452  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3375  hypothetical protein  51.64 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.773105 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2921  hypothetical protein  52.54 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0401  hypothetical protein  50.41 
 
 		 140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000990736  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2144  protein of unknown function DUF309  44.26 
 
 		 135 aa  121  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00366421  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2442  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  96.7  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1640  hypothetical protein  39.42 
 
 		 126 aa  88.2  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.902049  normal  0.797151 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4386  hypothetical protein  38.53 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1566  hypothetical protein  37.39 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.358395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3749  protein of unknown function DUF309  38.46 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.808208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2505  protein of unknown function DUF309  40 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.930715  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1551  protein of unknown function DUF309  36.84 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1524  protein of unknown function DUF309  35.96 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2231  protein of unknown function DUF309  41.07 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0073  hypothetical protein  46.67 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10001  hypothetical protein  43.04 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.181557 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2878  hypothetical protein  38.04 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08251  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.584511  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0515  hypothetical protein  38.54 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0771  hypothetical protein  36.71 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.911885  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16771  hypothetical protein  37.36 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.368131 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08231  hypothetical protein  34.23 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.603179  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5850  hypothetical protein  35.09 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08201  hypothetical protein  30.38 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1235  hypothetical protein  41.25 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1244  hypothetical protein  37.5 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2698  hypothetical protein  38.36 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.853504  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07991  hypothetical protein  32.97 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.17478  normal  0.712316 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0167  hypothetical protein  33.71 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0955235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4127  hypothetical protein  34.52 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.748452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4079  hypothetical protein  32.14 
 
 		 172 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000020689 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1070  hypothetical protein  34.83 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4190  hypothetical protein  34.52 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0992811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3815  hypothetical protein  32.14 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.843824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3800  hypothetical protein  32.14 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4168  hypothetical protein  34.83 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0998501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3889  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0133  hypothetical protein  31.53 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.732285  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2234  protein of unknown function DUF309  31 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.376682  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0206  protein of unknown function DUF309  35.63 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4845  protein of unknown function DUF309  34.94 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4280  hypothetical protein  30.95 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.477522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3969  hypothetical protein  30.95 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.61389  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3823  hypothetical protein  32.48 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.40568  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3911  hypothetical protein  32.48 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3837  hypothetical protein  32.48 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0327669  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1170  protein of unknown function DUF309  34.67 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105059  normal  0.0466669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0964  hypothetical protein  34.85 
 
 		 158 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.543165  normal  0.343587 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4640  hypothetical protein  30.68 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4911  hypothetical protein  37.25 
 
 		 200 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00161519 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  30.53 
 
 		 494 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3021  protein of unknown function DUF309  45.83 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5496  protein of unknown function DUF309  33.77 
 
 		 185 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000612718  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0208  hypothetical protein  36.36 
 
 		 177 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1989  hypothetical protein  40.3 
 
 		 184 aa  44.3  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0473  hypothetical protein  39.29 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03460  protein of unknown function (DUF309)  30.99 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0390  protein of unknown function DUF309  35.71 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2758  hypothetical protein  32.35 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2113  hypothetical protein  29.17 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.18714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3533  hypothetical protein  36.36 
 
 		 69 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2994  hypothetical protein  37.74 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.415801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>