56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4911 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4911  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00161519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4845  protein of unknown function DUF309  61.68 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03460  protein of unknown function (DUF309)  59.22 
 
 
158 aa  119  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5496  protein of unknown function DUF309  57.52 
 
 
185 aa  117  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000612718  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0133  hypothetical protein  57.69 
 
 
165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.732285  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5850  hypothetical protein  61.46 
 
 
163 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0206  protein of unknown function DUF309  57.01 
 
 
180 aa  111  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0964  hypothetical protein  59 
 
 
158 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.543165  normal  0.343587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0208  hypothetical protein  55.45 
 
 
177 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3823  hypothetical protein  55.45 
 
 
159 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.40568  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3837  hypothetical protein  55.45 
 
 
159 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0327669  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2994  hypothetical protein  61.26 
 
 
158 aa  106  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3911  hypothetical protein  55.45 
 
 
159 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0473  hypothetical protein  58.33 
 
 
149 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  56.44 
 
 
494 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1989  hypothetical protein  54.46 
 
 
184 aa  98.2  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2231  protein of unknown function DUF309  44.62 
 
 
140 aa  58.2  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2442  hypothetical protein  39.19 
 
 
131 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0771  hypothetical protein  31.58 
 
 
122 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.911885  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0073  hypothetical protein  36 
 
 
137 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08251  hypothetical protein  31.58 
 
 
122 aa  52.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.584511  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2234  protein of unknown function DUF309  40 
 
 
171 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.376682  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1630  hypothetical protein  40.96 
 
 
126 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.744656  normal  0.821485 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0401  hypothetical protein  34.31 
 
 
140 aa  52.8  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000990736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2758  hypothetical protein  42.86 
 
 
172 aa  52  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08231  hypothetical protein  31.58 
 
 
122 aa  51.6  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.603179  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2878  hypothetical protein  39.73 
 
 
139 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1070  hypothetical protein  39.29 
 
 
172 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4168  hypothetical protein  39.29 
 
 
172 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0998501  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1566  hypothetical protein  36.51 
 
 
149 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.358395  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08201  hypothetical protein  29.33 
 
 
128 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4190  hypothetical protein  39.29 
 
 
172 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0992811  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4079  hypothetical protein  39.29 
 
 
172 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000020689 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3800  hypothetical protein  39.29 
 
 
172 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4127  hypothetical protein  39.29 
 
 
172 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.748452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3815  hypothetical protein  39.29 
 
 
172 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.843824  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2921  hypothetical protein  37.84 
 
 
130 aa  49.3  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3889  hypothetical protein  39.62 
 
 
172 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3140  protein of unknown function DUF309  36.51 
 
 
130 aa  48.9  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10001  hypothetical protein  36.07 
 
 
137 aa  48.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.181557 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16771  hypothetical protein  37.18 
 
 
129 aa  48.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.368131 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4386  hypothetical protein  35.71 
 
 
132 aa  47  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2144  protein of unknown function DUF309  33.33 
 
 
135 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00366421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4280  hypothetical protein  39.29 
 
 
172 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.477522  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1244  hypothetical protein  37.1 
 
 
118 aa  47  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1640  hypothetical protein  37.5 
 
 
126 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.902049  normal  0.797151 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3969  hypothetical protein  39.29 
 
 
172 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.61389  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2505  protein of unknown function DUF309  33.33 
 
 
119 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.930715  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0515  hypothetical protein  36.07 
 
 
140 aa  45.8  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1147  protein of unknown function DUF309  37.25 
 
 
127 aa  45.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1235  hypothetical protein  35.71 
 
 
121 aa  45.4  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0167  hypothetical protein  30.14 
 
 
126 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0955235  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2698  hypothetical protein  36.51 
 
 
121 aa  45.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.853504  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0390  protein of unknown function DUF309  43.14 
 
 
179 aa  44.7  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07991  hypothetical protein  31.43 
 
 
126 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.17478  normal  0.712316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3375  hypothetical protein  33.87 
 
 
137 aa  41.6  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.773105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>