49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2234 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2234  protein of unknown function DUF309  100 
 
 
171 aa  352  1e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.376682  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0390  protein of unknown function DUF309  58.43 
 
 
179 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4190  hypothetical protein  46.06 
 
 
172 aa  158  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0992811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4127  hypothetical protein  46.06 
 
 
172 aa  158  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.748452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4079  hypothetical protein  43.79 
 
 
172 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000020689 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3800  hypothetical protein  44.24 
 
 
172 aa  154  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3969  hypothetical protein  43.64 
 
 
172 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.61389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3815  hypothetical protein  44.24 
 
 
172 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.843824  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4280  hypothetical protein  43.64 
 
 
172 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.477522  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3889  hypothetical protein  42.86 
 
 
172 aa  147  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2758  hypothetical protein  44.71 
 
 
172 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4168  hypothetical protein  41.21 
 
 
172 aa  144  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0998501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1070  hypothetical protein  40 
 
 
172 aa  142  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1553  hypothetical protein  34.57 
 
 
168 aa  82  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1584  hypothetical protein  34.57 
 
 
168 aa  82  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1059  hypothetical protein  32.05 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.250489  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4911  hypothetical protein  40 
 
 
200 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00161519 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2878  hypothetical protein  29.17 
 
 
139 aa  51.2  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1147  protein of unknown function DUF309  31 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1244  hypothetical protein  27.03 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4845  protein of unknown function DUF309  41.07 
 
 
156 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0401  hypothetical protein  31.78 
 
 
140 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000990736  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3140  protein of unknown function DUF309  31 
 
 
130 aa  48.5  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2921  hypothetical protein  35.82 
 
 
130 aa  48.5  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2442  hypothetical protein  26.88 
 
 
131 aa  48.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0133  hypothetical protein  34.48 
 
 
165 aa  48.1  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.732285  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2144  protein of unknown function DUF309  28.95 
 
 
135 aa  47.8  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00366421  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1235  hypothetical protein  24.32 
 
 
121 aa  47  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3823  hypothetical protein  34.25 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.40568  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5496  protein of unknown function DUF309  30.95 
 
 
185 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000612718  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03460  protein of unknown function (DUF309)  38 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3837  hypothetical protein  34.25 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0327669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3911  hypothetical protein  34.25 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  41.82 
 
 
494 aa  45.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3375  hypothetical protein  35.94 
 
 
137 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.773105 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0073  hypothetical protein  32.56 
 
 
137 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1664  hypothetical protein  36.21 
 
 
137 aa  44.7  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00161452  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1989  hypothetical protein  29.79 
 
 
184 aa  44.7  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2231  protein of unknown function DUF309  40 
 
 
140 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16771  hypothetical protein  24.55 
 
 
129 aa  44.7  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.368131 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0208  hypothetical protein  29.27 
 
 
177 aa  44.3  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10001  hypothetical protein  27.62 
 
 
137 aa  44.3  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.181557 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2994  hypothetical protein  35.71 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0206  protein of unknown function DUF309  38 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07991  hypothetical protein  26.55 
 
 
126 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.17478  normal  0.712316 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0167  hypothetical protein  25.66 
 
 
126 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0955235  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4640  hypothetical protein  43.86 
 
 
119 aa  42  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0473  hypothetical protein  30.56 
 
 
149 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08201  hypothetical protein  26.37 
 
 
128 aa  41.6  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>