52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_03460 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_03460  protein of unknown function (DUF309)  100 
 
 		 158 aa  316  9e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5496  protein of unknown function DUF309  72.18 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000612718  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0206  protein of unknown function DUF309  69.85 
 
 		 180 aa  184  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0208  hypothetical protein  55.47 
 
 		 177 aa  157  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3823  hypothetical protein  56.38 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.40568  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3911  hypothetical protein  56.38 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3837  hypothetical protein  56.38 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0327669  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4845  protein of unknown function DUF309  58.96 
 
 		 156 aa  155  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0133  hypothetical protein  56.03 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.732285  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0964  hypothetical protein  58.39 
 
 		 158 aa  148  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.543165  normal  0.343587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5850  hypothetical protein  55.47 
 
 		 163 aa  147  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  51.41 
 
 		 494 aa  142  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0473  hypothetical protein  60.34 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1989  hypothetical protein  60.48 
 
 		 184 aa  136  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2994  hypothetical protein  55.15 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4911  hypothetical protein  59.22 
 
 		 200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00161519 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2231  protein of unknown function DUF309  38.78 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08201  hypothetical protein  30.93 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2878  hypothetical protein  34.38 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0771  hypothetical protein  31.91 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.911885  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2442  hypothetical protein  32.29 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1235  hypothetical protein  35.23 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08251  hypothetical protein  30 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.584511  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08231  hypothetical protein  29.79 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.603179  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1244  hypothetical protein  32.95 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0073  hypothetical protein  26.36 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1566  hypothetical protein  25.98 
 
 		 149 aa  51.6  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.358395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2921  hypothetical protein  37.33 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0515  hypothetical protein  32.81 
 
 		 140 aa  48.5  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3140  protein of unknown function DUF309  32.88 
 
 		 130 aa  47.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0401  hypothetical protein  30.34 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000990736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2758  hypothetical protein  43.14 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16771  hypothetical protein  30.21 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.368131 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2234  protein of unknown function DUF309  38 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.376682  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0390  protein of unknown function DUF309  34.07 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1630  hypothetical protein  43.33 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.744656  normal  0.821485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1640  hypothetical protein  29.73 
 
 		 126 aa  44.7  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.902049  normal  0.797151 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1664  hypothetical protein  31.86 
 
 		 137 aa  44.3  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00161452  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0167  hypothetical protein  25.49 
 
 		 126 aa  44.3  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0955235  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2505  protein of unknown function DUF309  28.57 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.930715  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1147  protein of unknown function DUF309  30.99 
 
 		 127 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10001  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.181557 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07991  hypothetical protein  27.38 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.17478  normal  0.712316 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4168  hypothetical protein  30.3 
 
 		 172 aa  42  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0998501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4079  hypothetical protein  31.82 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000020689 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4190  hypothetical protein  31.82 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0992811  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3889  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  42  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3815  hypothetical protein  31.82 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.843824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3800  hypothetical protein  31.82 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4127  hypothetical protein  31.82 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.748452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1070  hypothetical protein  30.3 
 
 		 172 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3375  hypothetical protein  23.58 
 
 		 137 aa  40.8  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.773105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>